まず、１１０丁目の宿まで荷物を持って移動することです。
事前に確認しておいて、チェックインまでフロントで預かってもらうようアレンジして下さい。１いっても１時頃から３時頃までの時間つぶしですよね。
ハーレム散策してはいかがですか？１１０をずっと西にあるいたらセントニコラスという通りに当たるのでそこを北上して１４５ぐらいまで散歩してみたら？
結構起伏があって面白いデス。

徒歩でも自転車でも夜はおすすめしません。
一歩入ると雰囲気が一変するのは今も昔もかわりません。
「あ、ヤバい！」と思って腰が引けたときが相手にとっての好機。どこで見ていたのかと思われるような人数と巨体に囲まれ、身ぐるみ剥がれるケースが、あとを絶たない、どころか、近年増えています。ブルックリンのヒップな場所は、ほとんどすべて10年前は凶悪犯罪の温床でした。よって、そのような場所に探訪を計画する場合は、かならず地元の人を同行して下さい。
基本的に、アメリカ、NYでは一人旅、というスタイルは一般的ではなく（ヒッチハイクや異性ハントを別として）、セントラルパークなどでも日が暮れたら入園は禁物です。

ニューヨーカーは、出会った相手が、どこからいつ来ようがまったくお構いなしです。
そこで、JFKに下り立った瞬間から、「ここはワタシの街」という顔をして歩くのがコツです。
日本の方はよく「日本から来ました」「東京でデザイナーしてます」などとサービス精神からか自分の私的側面を披瀝する傾向がありますが、よっぽど素性の知れた間柄でない限り、このサービスは「不要」です。とくにホテルや宿回り、レストランなどで、自己宣伝は禁物です。

そんなとこかな、基本は。あとは自分らしくNYを楽しんで下さい！

・ニューヨークを3日程度でまわる場合の見るべき場所・おすすめのホテル
見るべき場所；
メトロポリタン美術館、マディソンスクエアガーデンでのスポーツ観戦（ホッケー、バスケがシーズン中）、メトロポリタンオペラ（シーズン中）、カーネギーホールでのクラシックコンサート、ロックフェラーセンター「トップオブロック」からの眺め（エンパイアステートビルが正面に見えます）、セントラルパーク散策、４２丁目にあるライブスポット「BBキングにて「ゴスペルブランチ」、ブルックリン橋でイーストリバーを渡河。マンハッタン周遊「ディナークルーズ」、グランドセントラル駅、ピータールーガー・ステーキハウスで本場熟成肉のポーターハウスステーキ。
そして、ブロードウェイ・ミュージカル鑑賞などなど
・初心者1人で観光は無謀かどうか（英語は不得意です・・・）
１人だと、回れる場所が限られます。市内観光バスなどに乗られるのがいいと思います。公共交通の利用は、ちょっと、あぶないかな。（迷うという意味で）

▼前提情報
・渡航時期は11月上旬～中旬（恐らく11/10～12か13くらい）
いい時期です！セントラルパークの紅葉最盛期。
・海外旅行初心者（日本国内の旅行は好き。国内であれば一人旅も苦にはなりません）
アメリカは基本、車移動の社会なので、勝手がやや違うかもしれません。あと、NY市民は、全般に親切なのですが、忙しいので、観光客にたいしてややぞんざいな印象をもたれるかもしれません。
・興味があること・行きたいところ（あまり調べられていないのですが）
教えてください。興味の数だけニューヨークがあります。
→自由の女神・美術館めぐり・公園でまったり・絵本さがし・ショー鑑賞・美味しいごはんなど。
これは、お手伝いできますよ。絵本は専門店があります。古書店で絵本を探すのも楽しいかもしれません。公共図書館には「クマのプーさん」のモデルになった本物のぬいぐるみがあります。パークには、ピーターパンやアリスの像があります。

今は、何もありません。見る影もありません。
その周辺はバワリーとよばれる地域で、かつては乞食と犯罪とアルコールが蜷局を巻く汚れた街でしたが、いまは最もヒップなエリアのひとつです。小ぶりで良心的なレストランや地ビールの店、自然食系のスーパーなどあります。

3回も！もう全身ニューヨーカーですね。
マンハッタン内でしたら；
アッパーイーストサイドの小ぶりなミュージアムはいかが？
メトロポリタンの向かいの「ノイエギャラリー」は、化粧品で有名なエステー・ローダーの旧邸。彼が集めたウィーン世紀末絵画のコレクションが秀逸です。絵のテーマが「大人向き」なので18歳以下は入館禁止ですが。
ハーレムのハミルトンはいつにある「ジュメル・モリス」邸もおもしろいですよ。ワシントンが独立戦争時に砦を構えたところ。その後、上流階級のお屋敷になって、今も保存が行き届いています。
６３丁目とレキシントン通りの角にある「イラストレーション美術館」もこじんまりしていいです。２階のレストラン／バーが雰囲気あります。

あと、マンハッタンから出て、クィーンズやブルックリンに行けば山ほど「秘密の」場所があります。ブルックリンのコニーアイランド遊園地を訪ね、レトロなライドと元祖ホットドッグを楽しんだあとに、地元のマイナーリーグ「ブルックリンサイクロンズ」の試合を見る何てのもいいですよ。（ヤンキーズみたいに高くないし）ご質問者様が、どんなジャンルに関心あるか、もう少しお聞かせいただければ絞って情報提供できます。

日産タクシーは、10台に一台ぐらいの割合で走っています。市内の有名ホテル前などでしばらく待ってると必ず「出会え」ますよ。
Uberは僕は使わないですが、高校生の娘でもよく友達と使ってるぐらいですから、普及度は半端じゃありません。空港周辺ホテルのまわりにはうじゃうじゃいるのではないでしょうか？アプリの使い方に精通されている方ならすぐ使えますよ。日本のお客様からも使ってよかった、という感想もよくききます。たしかにラッシュ時のイエローキャブはつかまりにくい上に、運転態度がよくないのでいただけません。

自由の女神は、比較的最近、一般参観が再開されたため、非常に人気のスポットです。
英語ですが、女神訪問の日時が確定しているのであれば、ネットで事前購入をおすすめします。
こちらから。Book Nowのボタンで進んで下さい。また、万一、英語だとわかりづらいとの印象をお持ちであれば、旅行エージェントまたは滞在ホテルのコンシェルジュを通じて、チケットを購入することも可能です。いずれにしろ、女神は予約が必須。見学には「台座のみ」「王冠まで」の２種類あります。せっかくいかれるのでしたら王冠まで上られたほうがいいと思いますので、ぜひ、そちらの予約を。リバティ島、エリス島行きの周遊フェリー代を含め、「王冠まで」２１ドルです。また、お一人で行かれる場合には写真・自撮り棒のご持参を推奨します。

女神観光は一日仕事です。疲れてしまいますが、港に戻ったら９／１１テロ事件の慰霊施設を訪ねられたらいかがでしょうか？日本人犠牲者のご芳名も刻まれた慰霊の碑は、お参りするといいです。その他、マンハッタン南端エリアでの見どころは、「アメリカインディアン博物館」「フローンセス・タバーン」（1783年に独立戦争が終結した時に時の将軍ワシントンが自軍の兵士に別れを告げた場所。いまでも酒場として機能）「ニューヨーク証券取引所」（外からのみ）「フェデラルホール」（ワシントンが初代大統領として演説した場所）「ニューヨーク連銀」（運良く予約ができるとツアーで金塊の山積する金庫を見学できます）「デルモニコズ・レストラン」（ニューヨーク一古いレストラン）、「センチュリー２１」（ブランド物の格安店）。
などがあります。

aka, NoMad,Ace, William, Libraryこのあたりを探ってみては？

一人旅ですか？できればお友達とのご旅行をお勧めします。もちろん、お問い合わせにある場所への訪問でしたら全く安全ですので、お一人でも十分楽しめます。宿はできればマンハッタン内にお取りになる方がいいでしょう。但しハイシーズンなので一泊２００ドルはします。やはり気の置けないお友達との同宿折半がお得です。ニューヨーク観光のポイントは「日本だったらとても値段や「敷居」が高くて手の出ないようなイベント、観劇、スポーツ観戦、パーティーなどを旅の「目玉」として入れておくことです。ざっくばらんに街をみるだけだと、東京や香港とあまりかわらないなあ、という印象で終わってしまうので。あと、長年会ってなかった友人やメールだけで繋がってた外国の仕事仲間に会いに行く、といった目的意識も入っているといいですね。
夜は12時以降は、観光の方は絶対に出歩かないで下さい。一見、安全そうで、渋谷みたいな盛り上がりが目に入りますが、この時間に騒いでいるのは地元の人間が中心です。観光の方は、この時間帯に犯罪に遭遇しても、全くいいわけが通用しませんので、ご理解下さい。では、よく計画して、楽しいご旅行を！