すでに対応可能な方からのお返事があったかもしれませんが、私もこの時間帯は対応可能です。

寄って欲しい名所・ポイントをいくつか具体的に挙げると、行程が組みやすくなると思います。
例：
ゴールデンゲートブリッジを渡って向こう側からSFダウンタウンを見たい。
コイットタワーに上って、市内全貌を見渡したい。
ケーブルカーに乗ってみたい。
ゴールデンゲートパークの博物館や美術館に行きたい
ビクトリア様式の住宅を見たい
ロンバート通りを通ってみたい

シリコンバレーと言っても広いです。
スタンフォード大学の教会やロダンの彫刻がある庭にやフーバータワーに行きたい
特定の企業の入り口・看板の前で写真を撮りたい

SFからシリコンバレーの中心部まで距離にすれば50－60キロですが、曜日や時間帯によってはかなり渋滞し、移動に時間がかかります。1日で両方は無理かなと思います。

思い出に残る旅行ができますように

もしUber/Lyftを利用されるのであれば、移動該当時間にMapをチェックして、道の渋滞状況や所要時間を確認しておくと良いと思います。ちなみに今日火曜日の夕方5時10分までだとディスニーランドからサンタアナ空港までは所要時間20分と出ます。

往路：オークランド空港に4時半に到着するとしてその時間はさすがに通勤渋滞はまだ始まっていませんので、30分弱くらいだと思います。（今なら50分ですが）

Priority and Express Lanesがどのような特典なのかわかりませんが、空港では普通の列とTSA Preという列があり、TSAに事前登録しているとこちらのTSA Preが利用できます。荷物からPC等を出さない、靴を脱がない等の特典があります。国内線ですので2時間前にチェックインする必要はないと思いますが、少なくとも90分前にはチェックインした方が良いと思います。60分前だと手荷物検査の列が長い時にハラハラドキドキしてしまいます。

ディズニーランド、楽しんできてくださいね。

何にご興味があるのかによりけりですし、2月だと雨季最盛期でお天気が予想できないという条件が付きます。
SF市内には多くの美術館があります。サイエンス系がお好きであればExplatoriumもお薦め。
SF Architecture Walking Tour もお薦めです。
個人的には、Castro地区に行って、おしゃれなカフェで道行く人々（かなり多様で奇抜）を眺めるのも好きです。
写真がお好きであれば、高層ビル群の合間にある公園（例：セールスフォースタワー前の公園）やGWを渡った向こう側からSFダウンタウンを望む風景も絵になります。
ワインがお好きであれば、ソノマのワインカントリーまで足を延ばすという案もあります。
SFの万引き、車上荒らし、浮浪者など悪いニュースも増えていますが、日中、大勢の観光客がいるような場所なら問題はないと思います。
楽しい観光ができますように。

サンノゼ空港からサンフランシスコ空港までは、渋滞無しの時間帯で約1時間かかります。渋滞する2時間くらいは平気でかかります。曜日によっても渋滞の仕方はかなり違います。雨の時期になりますと事故が多発するので、さらに所要時間がかかります。

公共交通機関が発達していないので、「効率よく」移動する＝公共交通機関でもいかれる、くらいに考えた方が良いと思います。時間的な効率が良いのは、タクシーやUber（ride share）の利用です。Uberも最近はハイヤーのように数時間拘束するというオプションが出たようです。

まずは、サンノゼ空港を何時に出られて、サンフランシスコ空港までに何時に到着したいのかを明確にして頂かないと、効果的なアドバイスができません。

「IT企業の見学」とはどういう意味ですか？　企業の看板の前で記念写真を撮るということでしょうか？　シリコンバレーのIT企業と言ってもアップルやグーグルに始まり、いろいろなスタートアップやベンチャー企業まで、さまざまあります。

まずは、ご自身で地図を眺めながら、どの企業に寄りたいのか、企業間の物理的距離はどのくらいあるのかを調べてから、具体的に相談されると良いと思います。

まずは、ヒューストンからSF経由で成田まで、荷物が預けられるのかをUAとZipAirの両方に確認する必要があると思います。もし一括で成田まで預けられるのであれば、手荷物検査を済ませたゲート側でターミナル間の移動をすることが可能となりますので、到着遅延が無い限り、3時間あれば十分に乗り継ぎできると思います。

お問い合わせ内容がZipAirで荷物を預け直すという前提なので、その場合の流れを考えてみます。
UA便の座席の位置によって、降機までにかかる時間が異なります。最前列に座っている場合と後方に座っている場合とでは、20分くらいの差がある気がします。一方で、早く降機できてもターンテーブルで預けた荷物が出て来るのを待たなければならない場合もあるので、降機が遅くてもあまり問題はないかも知れません。UAの場合、到着してから荷物が出て来るまでの時間は、だいたい30分程度が平均的と思われます。UAが到着する第3ターミナルから国際線ターミナルまでは、歩いて10分弱（7－8分程度）です。

UA便の到着後、ZipAirのチェックイン締め切りまでには2時間あるようなので、到着遅延さえなければ問題ないと思います。ZipAirで無事にチェックインができても、その後の手荷物検査の列に並ぶことになるので、そこで最低30分くらいはかかると思われます。6月だと学校が夏休みに入り旅行客が増えますので。従って、ZipAirは、ほとんどの人が搭乗し終わった最後の方に搭乗することになる可能性が高くなります。その場合、頭上の物入れがあまり空いていない可能性がありますので、荷物を入れるスペースが確保できるかどうかはアテにならないかも知れません。

あとは、到着遅延などのリスクをどこまで考慮するかだと思いますが、定刻到着、荷物もスムーズに出て来た場合には、3時間あれば乗り継ぎは可能ですが、途中でお土産を購入したり、ラウンジに寄ったりという時間的余裕は限られるかも知れません。

https://www.mclbbarstow.marines.mil/About/Base-Access/

上記に、アクセスパスの申請要項が記載されています。
ビジターセンターは普通に見学できますが、一般的には、基地内には入れませんので、それなりの訪問手続きが必要になるかと思われます。
基地祭の時は、訪問要件が異なります。

販売代理店からの購入になるのか、個人からの購入になるのかによって、輸出・搬送手続きが変わってくるような気がします。通関証明書の発行手続きなどのリサーチはご自分でやられますか？それともそれも含めてのご依頼内容になりますか？
私自身、オートバイファンでハーレーに憧れていた時期もあるので、お手伝いできるものならお手伝いしたいですが、工数見積もりができないと料金のご提案が難しいように思われます。
もう少し、依頼内容やご予算をお聞かせいただけますか？

お店は開いたり閉まったりしましたが、普段生活する分にはほぼコロナ前の状態という印象です。
コーヒー店はいろいろあります。Blue Bottle Coffee, Peet's Coffeeなどのチェーン店の他にもブティック型専門店がたくさんあります。豆専門店もあります。（私は自宅で焙煎するので、焙煎していな豆を購入して、自分で焙煎して、ブレンドします。）
SFやカリフォルニア州以外にもコーヒー専門店はあるのではないでしょうか。
例えば、Point Arenaという小さな町（ほぼ村のイメージ）にもLittle Green Beanというお店があり、そこでチョコレートも作っています。
NYにもたくさんお店があります。

いろいろとリサーチしてみてくださいませ。

シリコンバレーを拠点に会議通訳を30年以上やってまいりました。
企業視察のアレンジや取引商談、契約交渉のコンサルティングも行っています。
またワイナリーツアーのアレンジも可能です。個人的にはナパではなく、ソノマの北にあるメンドシーノワインカントリーその中でもアンダーソンバレーのワイナリーを中心に、日本に輸出したり、試飲会を開催したりしていますが、シリコンバレー界隈のワイナリーやナパのワイナリーのアレンジやワインの解説も可能です。