Takao さん
まずはアメリカという知らない土地での夜の観光はあまりお勧めできません。
どうしてもということであれば、まずは空港に戻ってくる事を頭に入れ
１－交通の便が深夜まである
２－比較的安全が見込める場所
ということになるでしょうか。
とすれば月並みですが、空港からサンフランシスコ市街地が一番かと思われます。空港から市街地までバート（地下鉄)で約３０分あまり、市街地ではケーブルカーにでも乗って雰囲気を味わい、安全なホテルの眺めの良いバーかラウンジで過ごすのは如何でしょうか？　食事もOKですがホテル内は高くなります。
因みに空港から市街地までのアクセスは
バート（地下鉄)　約３０分　＄８．６５
タクシー　２０分～４０分　　　＄４０ドル前後
空港シャトル　２０分～４０分　＄１７ドル
以上です

私個人としては、バート（地下鉄)が一番安く
使いやすいのでは・・と思います。

それでは良い旅をしてください
Kazu

Mico さま
サンフランシスコは観光とコンベンションの街として全米の中でも大変人気のある街です。その為にホテル代は他の街と比べるとかなり高いという印象です。名の通ったホテルならば1泊＄５００ドルを超えることも珍しくありません。
特に時期が観光シーズンだったり大きなコンベンション（見本市などのイベント)と重なると酷いものです。泊まる場所が無くなるだけでなく小さなモーテルまで＄２５０ドル以上取ることもよく見かけます。
全体的に高いホテル代ですが、安いホテル無いかといえば、実際に存在しています。ダウンタウン内に有り、多くが小さく少々古いイメージはありますが充分にホテルとして利用する価値はあると思います。
私が日本から来る友人たちに教えているホテルに
Hotel　Beresford やUnion Plaza Hotelというのがあります。ダウンタウンのユニオン広場から徒歩で数分、比較的安全な地域にあり徒歩での移動が非常に便利なエリアです。時期にもよりますが値段も1泊　＄１００～＄１５０ドルで充分と思います。　このエリアには他に同じような小さなブティックホテルが数件あります。後はお好みで探しては如何でしょうか。
さてサンフランシスコ空港からの交通ですが
地下鉄、乗合バス、タクシー、シャトルなど何でもOKです。
地下鉄は空港から乗り換えなしでダウンタウンまでおよそ２０～30分くらい。シャトルで乗合一人＄１７ドル、タクシーで＄４０～＄５０ドルくらいでしょうか。
また市内観光はケーブルカー、バスが便利です。市内観光バスに乗って半日回り好きな場所を次の日にピンポイントで行って見るのも得策かもしれません。Airbnb　OKですがダウンタウンはエリアには充分気を付けてお探しください、。テンンダロイン・エリアに隣接している場所も多いのでご注意してください。