クリスマスやメーデーなどの特別な休日でない限り、観光施設は開いています。
デパート、大規模店舗は、短縮時間で営業しています。（夏季期間）
飲食店も、観光エリアはほとんど営業しています。

小さなお店は休業のところもありますが、観光や食事に困ることはありません。

①　ビルバオを観光されるなら、ビルバオの空港でもよいでしょう。
サンセバスチャンで下りて、ビルバオへは、バスで移動されてもいいでしょう。
ただし、サンセバスチャン、ビルバオとも、便数は少ないです。

②　OMIOは、Renfeのオフィシャルサイトではありませんので、OMIOが受け持ったチケットしか表示されないようです。
Renfeのサイトをご覧になられましたか？

Renfeなら、所要時間は、最短で6時間少々です。
乗り継ぎ便ですと10時間ほどかかりますので、この早い便はすぐに売り切れます。
早い予約をお勧めします。
価格も、日程、予約日によって変動します。

飛行機の方が安いです。
ただし、便数が少ない、遅延が多発している、荷物の制限がある（有料）、空港までの移動、待機時間が必要、など諸々の条件をみまして、私は、列車での移動をお勧めいたします。

夏季期間は、観光エリア、及び、大手スーパーやデパートは、日曜、祝日も短縮営業しています。（だいたい、午後からの営業）

飲食関係は、ほぼ年中無休で営業しています。
観光施設も営業しています。

小さなショップは閉まっていますので、やや人出が少ないかもしれませんが、夏季の旅行にはさほど影響しないと思います。

存分にお楽しみください。

都市部と比べて安全だと言われていますが、絶対に被害に遭わないという保証はありません。
たとえ、リスクが低くても、それが自分自身に当たってしまえば、危険度100％ですから。
私ならば、荷物を預けるところを何らかの方法で探します。

お得かどうか断言できませんが、私は、いつも、オフィシャルサイトで購入しています。
他のオンラインサイトが定価より安いとは聞いたことがありません。
また、スタジアムで購入すると、発券手数料が高くなったと記憶しています。

サン パウ病院ではありませんが、他の観光施設で、私は電話で変更を依頼したことがあります。（２ケ所）

明確な回答になってなくて申しわけありませんが、メールでも可能なのではないかと思います。

施設によって、また、その時の担当者によって、提示を求めたり、しなかったりです。
でも、予約サイトには、「提示が必要」と書いてありませんか？
（これもサイトによって異なるかも）
いずれにしましても、提示出来るように準備しておいた方がいいでしょう。

パスポートの携帯は、盗難のリスクからできるだけ避けた方がいいと思います。
日本のパスポートの場合、コピーでも大丈夫です。（政府間の取り決めがありますので）

また、65歳以上でも、EU居住者に限定しているところもありますのでご注意下さい。

事前にチケットを購入するには、FGC（カタルーニャ公営鉄道）のプラザエスパーニャ駅で入手できます。

なお、各施設の入場券、クレマジェラ、バルセロナからの往復交通機関がセットになったチケットがありますが（webでも予約可能）、これは、往復とも同じ経路（登山列車かロープウェイのいずれか）でなければなりませんので、ご希望のルートでは利用できません。

また、「行きは鉄道と登山鉄道、帰りはロープウェイと鉄道を利用」とのことですが、逆にされることをお勧めします。
ロープウェイは、キャパが小さいので、乗車に並ぶことがあります。
そのため、バルセロナに戻るFGCの列車に間に合わなくなる可能性があります。

セット券ですと、各施設の予約は不要ですが、そうでない場合は、各施設の入場、黒いマリア像、コーラスなど予約が必要です。

現在、登ることができる生誕の塔、受難の塔は、双方とも完成していますので、工事の進捗とは関係ありません。

「塔を選べればエレベーター付き」とは、塔込みのチケットなら、エレベーターが付いているかということでしょうか？
塔に上るなら、エレベーターしかありません。
下りるのは、階段のみです。
なので、塔に上るなら、エレベーターの時間も予約できるチケットになります。

どちらの塔がお勧めかは、個人によります。
私の個人的な意見は、受難の塔です。

生誕の塔は、ガウディの設計によるものなので価値はあるのですが、内部の壁は、取り立ててみるほどのものではありません、
受難の塔との違いは、見える外の景色の方向です。

また、受難の塔の方が少し高く、景色を見る場所も、狭いですが、生誕の塔より見やすいです。
それに、時期によっては、工事現場が見えるとろもあります。
眺めたい景色の方向、若干の高さの違い、周囲の感じから判断することになります。

深夜にスーツケース持って６ブロックは、ちょっと距離感ありますね。
しかも、スペイン広場界隈の治安は、あまりいいとは言えません。
知った道でもないわけですから、絶対にタクシーをお勧めします。