1/4～5にベネチアに滞在予定です。

はじめまして、

toreviso在住です、ヴェネツィアからは
かなり離れているので、水害は全く関係ないですよ。

昨日も、ヴェネツィアに行ってきましたが
確かに午前中は水位が上がってる事が多いですが
歩けますし、長靴は結構荷物になりますよね。

現地で１０ユーロ出せば、靴カバーがどこでも
売ってますので、それを購入すれば十分ですよ。

トレヴィーゾの街の中心からベネチアまで車で40分位で電車だと30分位です。長靴は現地調達か潮が引いた時に観光できますよ！marea Venezia で検索するといつ何時にアクアアルタか分かりますし同時にいつ潮が引いてるか分かるようになってます。

他の方に回答にもあるかもしれませんが、いたるところで靴カバーを売っているため、長靴を持参する必要はないと思われます。
アックアアルタに関してですが、1月上旬はそこまで酷くないと思いますが、hi!tide Venezia というアプリでリアルタイムの潮の高さが確認できます。
サン・マルコ広場が海抜80cmですので、どのくらい沈んでしまうのか、またはどのくらい低いかがイメージしやすいと思います。
また、アプリでは向こう3日間の塩の高さの予測も見られるので便利だと思います！