一概にどっちが得とは言えませんが、一般的には別々に予約した方が、自分に合ったフライトも選べるし、ホテルのチェックインアウトも無理なく出来ると思います。
ツアコンが居なくても空港からホテルへは近いしタクシーで簡単に行けます。
シャングリラはセブでも超一流ですから、家族連れなら安心して滞在出来ますが、ビーチは人造ですし、とにかく高いホテルです。
ホテル、フライトとも割安感を得たいなら、もう少し検討した方が良いかもしれませんね。

日本と同じようにハニートラップでもなければ恋愛ですから問題ありませんよ。そういう店も警察に金払ってるので、警察官の目の前を店から連れ出しても黙認です。
出来れば素人の女の子をナンパした方が衛生的で安いです。1,000〜1,500位で１日仲良く過ごせます。

電気使用量に違いは出ませんが、フィリピンの電気料金は日本より高い感じです。
変圧器を介して100V家電を使うことは出来ますが、消費電力が高いと変圧器も高額です。
IHやマイコン付の製品だと非対応もあるので、よく確かめた方がいいですね。

日本からは100万円位は申告せずにフィリピンに持って来れます。

フィリピンからは10,000ペソ以上は無許可で持ち出せません。

LCCセブパシフィック航空で直行便が出てますよ。
プロモなら往復2〜3,000円、高くても10,000円以下じゃないかな。
ネット予約&カード決済出来ますよ。
つい最近三人分往復で買いましたが、20,000円位でした。

おっしゃる通りプリペイドはチャージする為に携帯電話が必要ですし、その後にコース(5日間とか30日間とか)を設定するのにも使います。

ほとんどのショップや空港でもやってくれますが、現地携帯も日本円で1,000円位からあるので、自分で買っても大したこと無いですし、更新時や通常の通話・テキストにも使えるので便利です。

携帯のSIMサイズはレギュラーですから、WIFIのサイズがミニならアダプターが必要です。兼用SIMも有ります。

それと、WIFIの機種や現地のキャリアによってはWIFIの中のAPNを書き換える必要があるので、スマホかタブレット又はPCを持って行った方がいいと思います。

たまにローカルなホテルだとファンだけの部屋がありますが、日本人が快適に過ごしたいならエアコン付の部屋を選んだ方が賢明ですが、それでも効きの悪い部屋は多いです。
特に５月はここで言うサマー時期ですから暑いです。
現地の人は逆にエアコンに慣れていないも多く、ファンだけでも抵抗ありませんが、彼らは皮膚の毛穴の状態が違っていて冷却効果に優れた体質になっているからです。

三回行きましたが、通話と3Gともsunはかなり不安定でキツいですね。globeとsmartなら大丈夫だと思いますが、時間帯や場所によっては感度が落ちます。
空港で全てセットアップしてくれるsmartのショップがあるので、エリアを聞いてみると確実です。フリーデータ通信は7日間で250ペソ位です。

先日モアルボアルのクオバディスダイブリゾートに２泊して来ました。
モアルボアルは３回目ですが、一番良かったホテルでした。
名前から想像すると、ダイバー向きに思えますが、シュノーケリングも少しだけ沖に出ればすぐに棚なので、沢山の珊瑚や魚を見ることが出来ます。
夕日と星空は絶景ですよ。
泊まるならバンガロータイプをおすすめします。
よく分かりませんが、シーシェパードが関与しているようでした。