ahinorstさん、こんにちは。Rede Expressos のサイトは以下の通りです。
https://rede-expressos.pt/pt
オンラインで購入できますが、窓口でも購入できます。支払いも、クレジットカード、現金ともに可です。

しおんさん、はじめまして。コインブラに棲息するさゆりです(蝙蝠か»自分)。
【1.について】この3カ所の移動に、公共の交通機関はありますが、それぞれの修道院は国内でも屈指の規模を誇る大伽藍で、見どころも多く、見学に思いのほか時間がかかるのと、タイミング次第では混んでいてスムーズに見学できるとは限りません。ご予定の時期は、ハイシーズン並みに人出があります。
バスの運行も、バターリャとアルコバサの間は近いので、さほど問題はないと思いますが、ここからトマールまでは結構離れているので、タクシー類は膨大な金額になると思います。到底お薦めできません。(最後に説明があります)
バターリャ・アルコバサ間のバスは、現地又はリスボンの観光案内所で詳しいことを教えてもらえると思います。
«« おススメルート »»
中間のファティマ Fátima (コーヴァ・デ・イリ―ア Cova de Iria)ないしはレイリア Leiria に1泊して、バターリャ・アルコバサ、トマール(キリスト修道院ですよね？)の組み合わせで2かに分けて見学することをお薦めします。レイリア、バターリャとアルコバサはそれぞれ隣接しています。ファティマは少し離れていますが、トマールへ行く途上にあるのと、大聖堂に参拝者のためにホテルが充実していますので、交通機関の状況と見比べてお選びください。古いお城に興味があるなら、もう少しトマールの近くまで移動して、オウレィン Ourém という街のお城見学というオプションもあります。
リスボンからの移動ですが、便数が多いのはリスボン―ファティマ(30/60分に1便)、その次に多いのがレイリア(概ね1時間に1便)。トマール、バターリャとアルコバサは、昼近くにしか便がありませんが、レイリアとファティマへは早朝から走っています。
【2.について】
Rede Expressos (https://rede-expressos.pt/pt) 、Rodoviária do Alentejo (https://www.rodalentejo.pt/html/default.asp) または Flixbus (https://www.flixbus.pt/) で検索してみてください。正直に白状しますと、私はRede Expressosをよく使いますがFlixbusは利用したことがありません。ただ、評判は良いです。
この3都市間もかなり離れています。タクシー類はお勧めしません。
【タクシーの利用について】(Uberは信用できないのと、コインブラはこちらのほうが最悪倍の料金がかかるので使ったことがありません)
タクシーは、それぞれ営業エリアが決まっており、その外まで走っても良い許可を持っている車を頼む必要があります。しおんさんの移動の場合、都市間の往復はしませんが、請求される料金は往復に相当する額になりますので、バスや鉄道などを利用してください。今回のご質問の各都市を移動するのは、中・長距離バスがいいと思います。
特にアレンテージョの移動は、間違いなく高速に乗ると思いますので、割増料金になります。よほどバスの時間とタイミングが合わない場合は、以上の条件を考えたうえでご判断ください。
またご質問があったら、お気軽にここに質問してくださいね。
よい旅を！

いぬさん、はじめまして。
まず初めに、この山火事での被災者へのお心遣い、深く感謝いたします。
余りにも広範囲、大規模な山火事が同時発生したため、消防の手が足りず、孤立し、自宅にある細いホースや小さなバケツで、死に物狂いで家を守ろうとした人たちは、みな孤独感にさいなまれています。いぬさんのお心遣いを、なんとかして彼らに届けたいと思います。
さて、おたずねの件ですが。
答えに窮する質問です。私の答えは、次の通りです。
1. 山火事全体は、ポルトガル北部へ向かって類焼が続いていますが、今日(19日木曜日)以降、気温が下がり、雨の予想も出ています。天気予報通りなら、近日中の山火事の終息が期待されています。昨日からはスペイン陸軍山岳部隊の応援が到着し、消防士の手が届かなかった地域にもようやく消防部隊が入り始めています。
2. 火災の影響のある中部および北部は、山火事の煙による大気汚染や、高速道路や主要道路の通行止めが相次ぎ、移動に困難が生じています。アヴェイロ以北の訪問は避けたほうがよろしいかと。いぬさんの訪問予定地にポルト、アヴェイロが含まれていますが、この地域は避けたほうがいいかも知れません。コインブラより南の各地は、比較的早く鎮火したため、大気汚染の影響は減少しつつあります。
«« まとめ »»
旅行をキャンセルするよりも、訪問地を変更するのをお薦めしますが、訪問の一番の目的がポルトまたはアヴェイロの訪問であれば、状況が落ち着くのを待って、改めて旅行を計画するのもいいかも知れません。リスボン在住の喘息もちの友人が、今仕事で北部を旅行していますが、早く帰宅したいと悲鳴を上げている通り、呼吸器系に何らかの慢性の症状をお持ちの方には、北部は避けたほうがいいエリアです。
訪問先を変更して、予定通りポルトガルへおいでになるのであれば、念のためマスク、食べ慣れているのど飴などをご持参ください。
最後になりますが、改めて、今回の山火事の被災者へのお心遣いに感謝します。予定通りポルトガルへお越しの際は、楽しい旅になりますように。

s0825kellyさん、はじめまして。
ビザおよび滞在許可証取得に関しては、EUの基準に則るものなので、オランダと条件は変わらないはずですが、大使館または駐日欧州連合代表部に問い合わせてみては？
駐日欧州連合代表部のサイトはこちらです。
https://www.eeas.europa.eu/delegations/japan_ja?s=169
お役に立てれば幸いです。

Masayuki_1970さん、はじめまして。
小口(100や200kgは少量と言われます)の船便輸送だと、郵便というのがポルトガルでは一般的ですが、インボイスの作成が煩雑だったり、発送地が英国だと状況が異なるなど、難点も多いかもしれません。
逆に質問ですが、英国発の鉄道での輸送は高価なんでしょうか？というか、英仏海峡トンネル経由の輸送ルートというのはないのかな、という質問です。
運送に詳しい方のコメントと合わせて、よかったら次の企業も参考になさってください。ポルトガルの企業で、海外でも営業を展開している会社は、スタッフの多くは英語を話せますので、ご心配なく。
1) 一般の物資輸送、引っ越しなど、様々な検索を試みたところ、上がってきたのが次の輸送会社。ポルトガルの企業です。
Trans Low Cost - https://www.translowcost.pt/english
2) 一般物資の輸送会社として、船便の検索にかかったのはこちら。英国の会社のようですが、ご存じですか？
Dachser - https://www.dachser.co.uk/en/
3) 貨物列車などで運ばれているコンテナでよく見かける会社のひとつで、こちらはポルトガルの会社です。
Rangel - https://www.rangel.com/en/
ちなみに私の引っ越しは、日本からポルトガルで、ものにより、航空便ないしは船便で送りました。Japan Postの段ボール箱ひとつが平均で25kgほど。船便でもさほど待たされることはありませんでした。目立った戦争がない、特にスエズ運河、ホルムズ海峡などの交通の要衝周辺が静かだった時期だったとしみじみ思います。
あまり明瞭な回答を差し上げられず、申し訳ありません。
ご参考までに。