ご自分の性格にもよりますが、以下のご参考にしてください。
搭乗は約30分前に始まります。JFKには出発2時間前には到着したいので、9時半を目指すとして、移動時間が約1時間ですと8時半ぐらいがいいかと思います。グラセンからJFKまでよく渋滞がみられるのはグラセンからミッドタウントンネルまでのマンハッタン内と後はクイーンズのジャマイカ地域。朝は通勤ラッシュですがの逆方向に向かいます。しかし、その結果、マンハッタンから出る方向のレーンが減ります。
私はバスは使いませんが、乗るとしたら、8時ぐらいに乗り場に行くと思います。
ANAのターミナル７は午前中はわりと空いています。他の航空会社は主に午後の便が多い為です。ですから、セキュリティもそれほど混雑していません。ただ、余り早くすべてが終わってしまうと、日本の空港と違って全くすることがありませんし食べ物にも期待できません。
また、搭乗時間はこの頃いつも20分ぐらい遅れてます。
よい旅を。
KazNY

天気がよければ、夕方のCentral Park (Jacqueline Kennedy pond。池の北側。マンハッタンの摩天楼をバックグラウンドにして）地下鉄の駅は９６ｔｈ　street、C か６ラインです。

仰る通りにこの日はアメリカでは最大の旅行日と言われています。アメリカ人はこの日の晩にサンクスギビングディナーを食べますので夕方に間に合うように前日か当日午前中に目的地に着くように計画を立てます。一番に気になされたほうがいいことは交通状態より、入国・税関の手続きです。JFKの場合は午後にとくにヨーロッパからの便が多い為混雑し、長蛇の列ができますが、午前中は少しましかと思われます。特に外国人には一人ひとりに時間が掛かり、もし、長蛇でしたら、待つしかありません。私はANA便のターミナル７をよく使いますが、途中にトイレなどもあります。運が悪ければ1時間をみたほうがいいかと思います。JFKからマンハッタンまでは休日ということで普段より混雑はしないと思いますのでタクシーで45分から1時間ぐらいかと思います。もちろん、AIR trainと地下鉄のEラインでマンハッタンにお越しになっても、荷物が少なければよいかと思います。当日の観光ですが、二つの場所に行かれるのは可能だと思います。ただ、長時間の渡航・時差なのできついかと思います。タクシー内で、また、夕方に睡魔が襲ってくるかと思います。

ろまんさん、
子供が小さいころよく連れていきました。一番手っ取り早いのはマンハッタンからの急行バスで行かれればブロンクスで迷わず心配しなくていいかと思います。また、暗くなければ動物園近辺も心配しなくても結構だと思います。GWの頃はすでに夏時間に変わっていますので夕方はそれほど早くは暗くならないと思います。
マンハッタンからでしたら1時間は掛からないと思います。でも、渋滞で遅れる可能性は常にあります。
以下のURLでどの動物を見たいか今から確かめられます。

また、この動物園は野生動物の研究にも力を入れていて、相当有名です。

マンハッタンからの急行バス
Mass Transit
Express Bus from Manhattan
The BxM11 express bus makes stops along Madison Avenue, between 26th and 99th Streets, then travels directly to the Zoo's Bronx River entrance (Gate B). For your return trip, pick up the bus just outside the same gate at the MTA BxM11 sign (just before the underpass).
https://bronxzoo.com/visitor-info/getting-here/transit

以下、ブロンクス動物園のURLです。
https://bronxzoo.com/