ご質問ありがとうございます。正直なところ、私はクスコについて詳しくありません。以下、私に可能な範囲でお答えいたします。

1. マチュピチュ遺跡は午前、午後の２度行く予定です。トイレは外のみ、食べ物は持ち込み禁止と理解しています。その他、気を付ける点などあったら教えてください。

2019年4月以降、傘の持ち込みが禁止されたそうです。レインコートを持っていかれた方がよいかと思います。ただ、6月ですと乾季になります。
あと、大きな荷物（一般的なリュックサックよりも大きいものを指すそうです）、ペットボトル、ビニール袋を遺跡内に持ち込むことができないそうです。飲み水は水稲に入れ、ゴミは出さないようにしていただけたらと。
あとは、火気厳禁で、禁煙だそうです。

2. Rainbow Mountainも興味があるのですが、Vinicuncaはめちゃくちゃ混んでいるようですね。午後は少しマシのようですが、午後に行くことのデメリットはありますか。また、Palccoyo というRainbow Mountainもあるようですが、バスなどはないのでしょうか。車を頼むとしたら、時間及び金額はどのぐらいかかりますか。

午後に行くデメリットは私にはわかりません。ただ標高4000ｍを超える場合、よく雨や霧が発生するのが一般的です。正午前後が比較的晴れやすい気がします。
おそらく、ツアーで行かれた方がよいようです。参考までに。
https://www.rainbowmountaintravels.com/es/tour-privado/

3. ペルーにいる間、e SIMを使おうと思っていますが、ペルーで一番確実に繋がりやすい eSIMの会社のオススメがあったらお願いします。ちなみに普段日本へ一時帰国の際はNomadを使っています。
ClaroかMovistarが良いと思います。ただ、リマ市内Centro de Atencionに行く必要があります。よく覚えていませんが、リマの空港内にはなかったような気がします。空港周辺の治安は悪いので、出られる場合は日中1時間以上書かrミラフローレスなど安全な場所で手続きされた方がよいかと思います。

では、ペルー旅行をお楽しみください。お役に立てると幸いです。

ご質問ありがとうございます。

リマもクスコもそこまで安全というわけではありませんが、いかにも観光者といった感じで、スマホを見ながら歩いていたり、財布をすりやすいところにしまうなどしなければ比較的安全は担保できるとおもいます。おそらく、主要道から外れることもないですよね？朝8時頃〜18時頃でしたら、より安全かと思われます。

18時頃にワンチャック駅からアルマス広場辺りを一人で歩いてホテルに戻ることを検討していますが、Uberに切り替えた方がいいでしょうか。
多分、主要道を使ってもらうとそこまでのリスクはないと思います。

最後になりますが、ペルーにお越しくださりありがとうございます。良い旅になることをお祈り申し上げます。

ご質問ありがとうございます。

Rossy Toursのバスについてですが、こちらのリンクでホームページに移動できるかと思います。
https://www.bookaway.com/routes/peru/puno/rossy-tours-puno?gad_source=1&gclid=CjwKCAiAtsa9BhAKEiwAUZAszZLaWL217krl1HGWIJT7M0kC1_DMwV7vNgj2dJpbCPkTuUd51eQgfhoCoFAQAvD_BwE

上のサイトでプーノ・フリアカ間を検索するといくつか結果が出ました。
https://www.bookaway.com/s/peru/puno-to-juliaca?departuredate=2025-02-18&adult=1
結構高いです。一人当たり、56ドルで空港まで4人乗りのミニバンで運んでくれるようです。バスの場合20ドルですが、空港までいかないようです。時間帯もかなり遅いですし、飛行機に乗られるならあまり意味がない気がします。
ミニバンはかなり融通が利くようで、上のサイトから購入可能で、時間帯や乗り場の指定が可能なように見えます。空港まで運んでくれるようです。

一応、会社のホームページのようです。
https://www.rossytours.com/

では、よい旅を。

ご質問ありがとうございます。
正直なところ、私のよく知る地域からは外れていますが、だいぶ前に逆のルートで移動したことがあるのでインターネットで捕捉しながらお答えできたらと思います。私が改めて移動するために軽く下調べをするという気持ちで行いました。

①上記の不安がある中、お勧めの長距離バス会社を教えてほしいです。
https://www.ticketsbolivia.com.bo/buses_paso1.php
こちらのサイトが参考になりそうです。
私ならば、Nuevo Continente InternacionalとTranszelaが座席が160°と快適そうなのでそちらを使いたいですが、昼間の移動はより安全さが増すので、そちらを優先されてもよいかと思います。基本的に、夜行の長距離バスはリスクが増加します。

②経路には、Copcabana（コパカバーナ）経由とDesaguadero（デサグアデロ）経由の2種があるそうですが、お勧めの経路などございますか？
私はデサグアデロ経由で移動しましたが、噂の通り、警察はわいろを要求してくるといったことはありました。コパカバーナの方が比較的安全だとネットでの情報では見たことがありますよ。

③ラパスとプーノ間の移動時間はおおよそどのぐらいでしょうか？
Copcabana（コパカバーナ）経由とDesaguadero（デサグアデロ）経由両方の場合を聞きたいです。（よく遅延する場合、どのぐらい遅れそうでしょうか？）
Copcabana（コパカバーナ）経由が、最短で7時間で、
Desaguadero（デサグアデロ）経由が、最短で6時間の様です。
ただ、10時間から12時間は見ておく方がよさそうです。

④今回の国境越えで何か注意するべきことなどあれば、教えてほしいです。（国境越えに2時間以上待たされた、国境が封鎖されていた、金銭を盗られたなどブログやガイド本等で読み、ビビっております・・・）
国境を超える際には正しく手続きをし、警察や税関担当者がおかしなことを言ってきた場合は信用しない方がよいです。私の場合は、通常通り手続きをした後に、街中で警察と会い、私にパスポートの提示を求めてきました。うっかり手渡してしまい、彼の指定する通常の5倍のタクシー代の車を使わないと返してくれないという問題が発生したことがあります。
あと、可能な限り正規ルートで国境は超えてください。少し安い車やバスなどの使用はやめ、できるだけよいバス会社を正規ルートで購入して移動してください。一度、観光で国境付近の海岸に行こうと思ったのですが、街中で安めのものを拾い、観光代理店を使わなかったときに、一番危険な国境付近に放置されるか、通常の3倍支払うかの2択を強要されました。

色々と危険もありますが、気を付けてペルー、ボリビアにお越しください。

ご質問ありがとうございます。

①-1 長距離バスの遅延は頻繁に起こるものだと考えて、計画をしたほうがよいでしょうか？
基本的には良かるものと考えていただいた方がよいです。5月ですと、土石流なども起こりにくいので、比較的安全かと思いますが、

①-2 頻繁に遅延する場合、何時間ぐらい余裕をもって計画を立てるべきでしょうか？
時間の問題というよりは、バスが故障したりする可能性があり、その場合の対応がバス会社では遅くなることがあるという話でしょうか。日本人観光客向けの車での対応などもされている方々がいますので、そちらの方がより確実かと思われます。

②ナスカの地上絵の見方
②-1 ナスカの地上絵はフライトで見たいと思いますが、ジェットコースターに乗るのが苦手な私でも乗れるでしょうか？（急降下やマイナスGがかかって内臓が浮く感じが苦手です）
乗り物に酔いやすい方は避けた方がよいかもしれませんね。対策としては前日にナスカ入りをし、早朝に出る、酔い止めを準備する、写真撮影に集中しすぎない、というくらいでしょうか。

②-2　ジェットコースターが苦手だったり酔いやすい人は、フライトよりも展望台でナスカの地上絵の見るほうが楽しめるでしょうか？
イカのオアシス都市(ワカチナ)などはそのような方の代替案としては良い気がします。

あまりお役に立てないかと思いますが、参考になれば幸いです。ペルー観光お楽しみください。

ご質問ありがとうございます。

Japanese Restaurant KINTAROの件は残念でしたね。
よくある話でっすが、麺がペルー人の好みに合わされることがよくあります。
またチャーシューが日本のもののように柔らかく味があるということはあまりないです。肉は基本的にかなり固いことが多いです。

前回もお伝えしたように、日本の方の舌に合うかどうかわかりませんが私はこちらで基本的に食べています。結構おいしいと感じています。

https://maps.app.goo.gl/LbdzHWisd1CMUnP1A

https://maps.app.goo.gl/u7MK8j6rRFY1KhNCA

どちらも私にはおいしいですよ。
お役にたてると幸いです。

ご質問ありがとうございます。

だいぶ前の情報で申し訳ありません。
私が食べた中で比較的良いものは、Japanese Restaurant KINTARO

https://maps.app.goo.gl/bN1fYXokKtQXCNY27

それなりに食べれました。ただ、ペルー在住期間が長いため日本の方の舌に合うかどうかなんとも保証できず申し訳ないです。

お役に立てると幸いです。

ご質問ありがとうございます。

初めに私はクスコに行くことはほぼなく、ネットで調べた情報であることお詫び申し上げます。
クスコは様々な観光先がありいつもうらやましく感じております。

https://www.getyourguide.jp/s?cq_src=google_ads&cq_cmp=10592916446&cq_con=105556339189&cq_term=&cq_med=&cq_plac=&cq_net=g&cq_pos=&cq_plt=gp&campaign_id=10592916446&adgroup_id=105556339189&target_id=aud-476515432771%3Adsa-927927904240&loc_physical_ms=9060937&match_type=&ad_id=701111637051&keyword=&ad_position=&feed_item_id=&placement=&device=c&partner_id=CD951&gad_source=1&gclid=Cj0KCQiAyoi8BhDvARIsAO_CDsB9lX9I1p2u_lwxL2MIdh33JsVLpEM-kwy-gn841cEDfXG35T7-NQEaAuaDEALw_wcB&q=%E3%82%AF%E3%82%B9%E3%82%B3&et=847569

https://www.getyourguide.jp/aguas-calientes-l91472/cusco-bus-to-hydroelectric-station-6-hours-t847569/?ranking_uuid=bdb3f26b-c95a-48c1-a55b-1535f197f690

こちらで購入できそうですよ。

お役に立てず申し訳ありませんでした。

ご質問ありがとうございます。

正直なところ私は言ったことがないので何とも答えにくいです。
以下に私がこれから行くなら、またスペイン語があまり使えないなら選びそうなサイトをいくつか添付しておりますので、ご覧ください。

https://www.hotholiday.jp/peru/machupicchu/?gad_source=1&gclid=Cj0KCQiAyoi8BhDvARIsAO_CDsBo5senMB5RAkKhpfk0TyeLYa7N34V0zhV9-ROVmy2i2Lv8dXZdl4gaArZ0EALw_wcB

https://www.getyourguide.jp/s?cq_src=google_ads&cq_cmp=10592916446&cq_con=105556339189&cq_term=&cq_med=&cq_plac=&cq_net=g&cq_pos=&cq_plt=gp&campaign_id=10592916446&adgroup_id=105556339189&target_id=aud-476515432771%3Adsa-928899241908&loc_physical_ms=9060937&match_type=&ad_id=716168083366&keyword=&ad_position=&feed_item_id=131888535941&placement=&device=c&partner_id=CD951&gad_source=1&gclid=Cj0KCQiAyoi8BhDvARIsAO_CDsAaUyxGkr6UqczxFIlURKtskrEg6p0KfZFChFJEVXfgcaVmGPJcMsYaAuRCEALw_wcB&q=%E3%82%A6%E3%83%AB%E3%83%90%E3%83%B3%E3%83%90&et=640607

https://www.yosip.org/clientevoice

https://www.illapatours.com/

質問が多いテーマですので、一度行っておく方がよいのかもしれませんね。
今回はお役に立てず申し訳ありませんでした。

ご質問ありがとうございます。

正直なところ購入したことはありませんが、少し調べてみました。
いかに関連するサイトを添付しておりますので、ご確認ください。

鉄道です
https://www.perurail.com/es/?gad_source=1&gclid=Cj0KCQiAyoi8BhDvARIsAO_CDsDLIajBTPEMGCtIbwG9MZ8fGTBbk6yG_oGVKn2b7TvKmyCg8fPKvnMaAgs2EALw_wcB

バスです
https://machupicchu.center/ja/USD/machu-picchu-bus-tickets?srsltid=AfmBOopWRXNKvZDgev9fprFzpYTyLrrf2PFAo0pXLJTNhLo1ud8HRwrc

公式サイトというのがよくわかりませんが、鉄道に関しては公式サイトではないかと思います。

お役に立てるとよいのですが。