アメリカの中でも比較的治安はよく、女性1人でも駅近のホテルを探せば大丈夫だと思います。ボストン市内(コープリ辺り)、ボストンハーバー沿いは高級ホテルばかりなのですが、駅は近く観光場所も集中していてロケーションがとてもいいです。予算に合うようでしたらご検討ください。
少し郊外になりますが電車グリーンライン沿いKenmor駅近くのバックミンスターホテル(フェンウエイ球場が近いです)、隣のブルックライン市になりますがホリデーインブルックライン、マリオットホテルコートヤード ブルックライン、日本人の方が経営しているTおばさんの家などが、日本の方々よく使われているホテルです。

コープリー、ヘインズコンベンションセンター近くの「summer shack」が手頃で、オイスターもロブスターもバッファローチキンなども食べられます。