はじめまして！
学生ビザのことは詳しくなく申し訳ないのですが、私は家族ビザを取得した時のことをお伝えします。

日本のボリビア大使館とボリビアの日本大使館に問い合わせて必要な書類を聞きました。

しかし、必要ないと言われた書類が実際必要だったり、必要だと言われた書類は必要なかったり。。ビザ窓口の担当者も曖昧で何度か通ってパスした、感じでした。

大変面倒だとは思いますが、在日ボリビア大使館、在ボリビア日本大使館、サンタクルスの大学に問い合わせて、必要と思われる書類をご用意されるのが良いかと思います。

URLをはっておきます。
在ボリビア日本大使館(サンタクルス事務所)
https://www.bo.emb-japan.go.jp/itpr_ja/santacruz.html

はじめまして！
ウユニのツアーは現地予約で大丈夫ですよ^_^
塩のホテルを事前に予約して、現地ツアーを予約する際に、塩のホテルに泊まります、と伝えればそこで降ろしてくれます。
(ピックアップがあったかは定かではありません。。)

現地ツアーはホダカツアーがおススメです。鏡張りの場所へ連れて行ってくれますよ。

間欠泉は行ったことがないので、情報をお伝えすることがでいなく申し訳ないのですが、ブログなどを探してみるのは以下がでしょうか^_^

こんにちは！
回答が遅くなり申し訳ありません！

現地のツアーはホダカツアーがおすすめですよ。日本人向けに水のあるところへ連れて行ってくれます。
到着したら、お店に行って、サンセットのツアーやサンライズのツアーを申し込むといいですよ。

ホテルは
ルシエルドウユニ
がおすすめです。
朝食がおいしいのと、シャワーも、強めです。
駅からも、ホダカツアーのお店にも近いですよ。
https://www.booking.com/hotel/bo/le-ciel-d-uyuni.ja.html?aid=323168;label=uyuni-2fu5B1tjA8FRYz_CzZ6qSgSM66621217162%3Apl%3Ata%3Ap115%3Ap2%3Aac%3Aap1t1%3Aneg%3Afi%3Atikwd-23808162041%3Alp9077266%3Ali%3Adem%3Adm;sid=7dcf3fc91147330c2769f529b34945a1;checkin=2019-02-28;checkout=2019-03-01;dest_id=-703926;dest_type=city;dist=0;group_adults=2;hapos=27;highlighted_blocks=86310502_86242885_2_1_0;m_occ=2;matching_block_id=86310502_86242885_2_1_0;ref_is_wl=1;room1=A%2CA;sb_price_type=total;srepoch=1551391581;srpvid=b1409b6ec157038a;type=total;ucfs=1&

ホテルの予約は現地に着いてからでもたくさんホテルがあるのでいっぱいでどこも泊まれない、ということはないと思いますが、到着が夜であればそこから探すのは暗いので危ないかもしれません。