プノンペン発着の場合にはシェムリアップまでの移動にバスやミニバンなどで6時間はかかります。夜行便もありますが、ご自分で空港から町に出て見つけるのは旅慣れていないと難しいかと思います。ですので、空路のチケットを予約されるのをお勧めします。最もいいのはシェムリアップは国際空港ですので、シェムリアップ発着に変更される事です。短期間の日程ではプノンペンからシェムリアップへの移動は時間が無駄です。シェムリアップでの主な遺跡巡りは一日か二日あれば可能です。

遺跡巡りはのバイクタクシー利用は、悪質なドライバーを避けるために、ゲストハウスやホテルに紹介してもらう事をお勧めします。たいていは悪は少ないと思いますが、念のためです。遺跡巡りのプランを立てて、半日か一日かを決めて下さい。
日本語の現地ガイドは何人かいて、それなりに詳しく説明してくれますが、ひとりでは料金的に大変です。一日で60〜80ドルはします。
そこで現地のツアーに参加するのをおすすめします。日本語ツアーもありますが、英語ツアーならたくさんあります。できれば歴史的背景などご自分である程度調べておかれるとより興味深く遺跡巡りができると思います。

・地元民に人気でよりディープでローカルなメニューがあるお店
郊外の湖畔にヤシ葺小屋を連ねたハンモック付の 店が地元民に人気で、チキン丸焼き、魚グリルや蒸し焼き巻貝などをビールで楽しむ家族連れが多いです。BBQも多くあり、なかには犬肉もあるそうです。生牡蠣など海鮮料理のオープンテラスの店もあります。
・ラグジュアリーでありながら伝統的なクメール料理のお店
Damnak Khmerなどが正統派クメール料理と言わるところもたくさんあります。要予約の高級店で創作クメール料理のCuisine Wat Damnakはお勧めです。日本の懐石料理風ですが、1/3〜1/4の料金で楽しめます。
・メニュー数が多くて美味しいお店
オールドマーケットの廻りなどにいっぱいあります。オープンなパティオのAaian SquareやNgoが孤児を育成し経営するマルムなど観光客に人気です。
・ヌンパンの美味しい屋台
屋台があちこちにあり、たいていは安価美味です。屋台より少し高いのですが、とくに美味な店が市内中心部にあります。
・ローカルで朝早くからお粥が食べれる美味しいお店
あちこちにたくさんあって、お粥だけでなくクィッティオ(米麺)や豚メシなど安価美味で庶民の朝食を担っています。
いつも私はクメールの人と一緒に行きます。イタリア製マシーンでいれるエスプレッソやカプチーノのおいしい屋台もあります。

シェムリアップの王宮の向かえにある寺院のプレアンチェック・プレアンチョムの廻りでおばさん達が売っています。午前中の8時〜9時ごろが売り子が多いそうです。
一羽あたり1ドル前後で複数かごに入っているので、数ドルか2万リエル(5ドル)程用意しておけば良いかと思います。

プノンペンからシェムリアップ間の遺跡との事ですが、世界遺産のサンポープレイクックが中間地点の町のコンポントムから近い所にあります。観光客はあまり行かないようですが、遺跡マニアの方でしたら見る価値はあるかと思います。またベンメリアの少し先にコーケー遺跡もありますが、こちらも一般的ではないようですが、マニアならお勧めです。シェムリアップ近くのバコン遺跡はツーリストも多く必見です。
ミニバスとツクツクなどを近くの町からチャーターすればお値打ちにいけます。
時期は問わないとの事ですが、雨期の最盛期の8月後半から9月から10月前半は避けたほうが無難だと思います。時間帯に限らず集中豪雨や雷の襲撃を受けるとツクツクなどではきついかと思います。

残念ですが、シェムリアップではロムドゥオルは3月下旬〜5月が花咲く季節のようです。今は花は散って実がなっています。来年の花咲く頃ならご期待に添えるかと思います。

残念ですが、私はプレアヴィヒアへは行っていないのでうまく回答できません。聞いた情報ではシェムリアップからは車で4〜5時間かかる為、ツアーは百数十ドルするようです。タイとの国境にあるカンボジア第二の世界遺産遺跡で高地にあり景観も素晴らしいく行く価値はありそうです。グループなら車をチャーターした方が安くなりますし、お一人でも遠距離バスやバンで近くの町まで行き、ゲストハウスに泊まってから遺跡へいけばかなりローコストで収まるはずす。別のお勧めはコーヒーで有名なモンドルキリです。ベトナムに近い高地で2年程前にエレファントトレッキングにいきましが、ジャングルでほぼ野生の象のグループと一緒に遊ぶのはエキサイティングな経験でした。

スマイリングホテル&スパは6号線沿いの街の中心部からは3キロほどの所ですので、まわりには現地の人用のローカルな店しかありません。普通の朝食ならホテルでの朝食ビュッフェがお勧めです。ローカルなクィッティオ(米の麺)やバイチュルック(焼き豚のせ飯)などなら近くのレストランにありますし、少し西の街の方へいけばプサー・ルー(街の最大ローカルマーケット)に屋台がたくさんあります。カフェはオールドマーケットの周りならイタリア製マシーンでいれるおいしいカプチーノもあります。短時間観光のオススメはチケットセンターの隣のパノラマミュージアム、その向かいのテキスタイルミュージアムそしてオールドマーケットの少し北側の寺院(ワット・プロムラット)などです。時間指定してツクツクのドライバーに言えば廻ってくれます。