ロットネスト島は船で渡りますし、ウェーブロックとピナクルズは反対方向なので、難しいと思います。

1.フリーマントルからフェリーでロットネスト島に行く予定ですが、この時期の混雑具合はどうですか。
学生たちの休みではないので余り混んでいないと思います。週末を避けるともっといいのではないかと思います。
2.冬場は夏より雨が多いと聞きましたが、雨や風によりフェリーが運航中止になることはよくあるのでしょうか。
今まで、十回以上行っていますが、キャンセルになったことはありません。よほどの悪天候でない限り、問題はないでしょう。

3.1歳の子連れなので、ロットネスト島以外はのんびりプランにしていますが、幼児でも楽しめる観光地はパース中心地にありますか。
色々なところがありますが、キングスパークがおすすめです。広大な公園で、眺望がすばらしく、ワイルドフラワーのガーデンなどがあります。また、二つほど幼児が遊べる公園もあります。バーべキュウなどもできます。
西オーストラリア大学とその近くのスワン河沿いもおすすめです。

4.ロットネスト島でのおめあてはもちろんクオッカワラビーなのですが、島のどこかに生息ポイントがあるのでしょうか。今回は島内をバス移動するのでそこまでフットワーク軽くないのですがそれでもクオッカと会えますか。
よほど運が悪くない限り会えるでしょう。もしバスで会えなかったら、レストランやゴミ箱近くにいると思います。暗くなるとぞろぞろ出てきますよ（笑）

5.お土産に息子にクオッカのぬいぐるみを買ってあげたいのですが、そのようなお土産はパースにはありますか。シドニーでは見つからずがっかりしました。
パースのお土産屋さんにもあったのを記憶していますが、ロットネスト島のスーパーにも売っていました。

イーストパースだと、パースの隣ですね。パースにはいろいろな安いレストランがあります。バラックスストリート沿いのレストランは、日本食、韓国料理等安い物が多いです。また、ノースブリッジにも近いので、中華料理のお店が多くてお手頃な値段で楽しめます。
西オーストラリア近くの川沿いにはマチルダベイという洒落たレストランやもう少しカジュアルなレストランもありますが、景色がいいです。
最近パース市内（ST Gorge通り沿い)には、カジュアルで洒落たレストランが増えているので、お一人で、片言でも、大丈夫だと思われます。イーストパースはパースの隣で、パース、ノースブリッジは広くないので、ちょっと歩かれて見たら、楽しいかもしれません。

オーストラリアのパースに住んでおります。
母がいるので、何度かそういう施設を見学させていただきました。また、母はそういった目的でいらした方たちを自宅近くの施設にあんないしたこともありました。
営利目的のところと救世軍などがやっている福祉施設等いろいろな形のものがあります。

ホテルはパース市街からバスで５分位のバースウッドというところにあります。多分、ホテルから送迎バスがでいると思いますが、ない場合はタクシーでも基本料金位でパース市街につけます。パース市街には、大型デパートやスーパー、また観光を兼ねて、ロンドンコートなどで買い物することができます。サイトを見させていただきましたが、普通のショッピングセンターがのっていなかったようです。パース市街から電車に乗っていけるショッピングセンターでは、クレアモントとフリーマントルがお薦めです。バスに乗って行けるショッピングセンターもありますが、ちょっとチャレンジかもしれません。どういう目的なのかによって、選ぶといいかもしれません。
観光スポットとしては、一番のおすすめがパース市内とスワン川を一望できるキングスパークです。市内にあるのに、とても広く１０月だとまだワイルドフラワーがさいているかもしれません。壮観な景色です。市内には川沿いにベルタワー、市街に美術館、博物館等があります。
あとのおすすめはUWA やフリーマントルなどです。