ファーストクラス（全席指定席）とセカンドクラス（自由席あり）があり、セカンドクラスは「２」と書かれた車両です。席に行くと、席番号の横にライトがついていればそこは誰かの席ということです。何も付いてたり表示がなければ、空席です。車両によっても、掲示方法は違うようですが、空席になる可能性がありなんて表示があることも。長距離の場合は、停車駅で、この駅までは空いていて、ここからは指定…なんてこともありますから、気をつけてください。

平日なら、指定席を取らなくても座れることも多いですが、週末はやはり指定席を買った方が確実かなと思います。特に、デュッセルドルフからフランクフルトだと、結構長距離になりますから。ただ、他は１時間程度ですし、とりあえず指定なしで挑戦してみても意外にオッケーかなと思います。

おっしゃっている通り、別に指定席であっても、人が来るまでは座ってても大丈夫です。

実際にこちらで、そういう難民についての事柄を目にすることはほとんどありません。
いつも思うことですが、日本はちょっとメディアが騒ぎ過ぎですね。
特に、心配される必要はないと思いますよ〜