住んでいらっしゃる方なのかご旅行で来られている方なのか分かりませんがお答えします。
主人曰く、業務用の食材を扱うスーパーマーケットであれば、おそらく生のトリュフを買えるそうです。以前見たことがあるそうです。たとえば、メトロという名前のスーパー。ミラノだとどこになるのか分かりませんが。。
他の方法があれば、また回答させて頂きますね。どうぞお気をつけて。[下記付け加え] 今調べた所によると、ミラノの中心地にURBANIというトリュフを扱うお店があるようです。Piazza delle Cinque Giornate という名前の広場の近くだそうです。マップで見ると5分くらいかな？ソース、パウダーなども色々あるようです。是非行ってみて下さい。10時から20時まで開いているようですよ。

インターネット参照ですが。このエリアには6:00から20: 30まで入る事が可能のようです。ただし中にある建物によっては、時間が異なるようです。Monestroでは、6:00から12:30と15:00から20:45まで開いている旨記載されているようです。お休みなどはかかれていないようですね。
宿泊が可能なゲストルームもあり、35euroだそうです。ただし、お祈りをしたい、メディテ-ションをしたいなど、しっかりした目的がある方のみとなっているようです。
もし不安なことがあれば、またお尋ね下さい。詳細の確認や必要な場合は施設への予約も承ります。(予約などの場合は別途料金を頂きます。)
寒い時期ですので風邪などひかれませんよう、どうぞイタリア旅行を楽しまれて下さい。Buon viaggio!