大抵の場合ペットボトルなどミネラルウォーターはお部屋に用意されていることが多いですが、必ずとは言い切れないので、直接ご宿泊先に確認することをオススメします。ペットボトルなどミネラルウォーターがあるかの確認をして、ないようでしたら、事情をお話すれば用意してくれると思います。
たまにエラーでお金が吸い取られてしまうのでオススメできませんが、一応公共交通機関の構内には自販機もあります。
食料は、アパートメントの説明で朝食付きでしたら、お部屋内にビスケットなど準備してあるかもしれませんので、こらもお問い合わせしてみてください。
余談ですが、電気ポットは十中八九お部屋にあると思います。イタリアの水道水は沸騰させれば飲めますので、お茶などにすれば、喉が渇いて大変な思いをすることはないかと思います。

駅周辺は気をつけていれば大丈夫ですよ。その時間帯に到着する人がたくさんいるので、宿側も大抵はチェックインの対応を問題なくしてくれます。駅からすぐとの事なので、真っ直ぐ早足で宿に向かってください。タクシーを捕まえる必要もないと思います。電車内の治安は良くないですが、イタロとのこと。日本でいう特急電車なのでイタロなら比較的安心です。