こんにちは。
わたしもワイナリーはツアーでしか行ったことがなく、、、おススメがあまりできないのですが、ブリスベンではなく、ゴールドコーストの方にはワイナリーが沢山あります(^ ^)ナショナルパークに行ったついでにワイナリーにも寄れるので楽しいかと思います。ツアーも色々とあるので是非そちらも参考にしてみて下さい。
役に立つご回答が出来ず申し訳ないです。

公共交通機関は朝早くから動いていますので大丈夫です^ ^
市内のホテルにお泊りであれば
Central station ,Roma street station が近いと思います。どちらもエアポートラインが通っているので空港まで電車一本で行けるので簡単かと思います。Go card というカードがあると便利ですが、なければ券売機でsingle ticket が購入できます。

日本食は寿司、ラーメンが人気です。
Sushi Edo, sushi train,Ginga 等がチェーン展開している回転寿司です。あとはフードコートなどでよく見るHanaichi. 手巻き寿司のお店は至る所に見ます。
高級レストランですと、SONO や KABUKI の名前をよく耳にします。
ラーメンですと豚骨ラーメンを主にしたお店がほとんどです。博多屋, げんこつ, shinobi, HAIHAI,太郎 など。
カフェはシティと郊外ではお店の雰囲気が違いますし、数え切れないほど沢山あるので好みは人それぞれですし、色々な所に行ってみるのがいいと思います。
ガイドは出来ませんが、私が個人的によく目にする人気？のお店をあげさせていただきました。
何かお役に立てば幸いです。

私はEast Coast car rentalsをよく利用しています。しかしながらcity にあるため、空港から遠く、駅からも少し歩いた場所にあるためお子さんを連れて歩くのは少し大変かと思います。
Jucy でレンタルした事はないのですが、ロードトリップなどをする方(キャンピングカーなどの利用)にはよく利用されている会社です。
あとはやはり空港近くの大手の会社を利用するのが1番安心かと思います。