正味3日間とのことで4泊5日でマクタン空港午後着・午前発のご予定かと思いますがその前提で回答させて頂きます。
3日間で1日セブシティで日中に観光するのであれば海で過ごすのは2日間ということになります。
正味3日で日本人に遭遇しないエリアに移動となると結構時間もとられますので、厳しいスケジュールになります。
本当ならセブはお勧めしないと回答するかもしれません
ですが、ＧＷと7.8月以外はそれほど日本人は多くはありません。
セブに訪れる観光客の殆どは韓国人で、日本人は上記の期間以外は2割ほどかと思います。
マクタン島の東海岸のリソートエリアが一番マリンアクティビティをする観光客が多いのですが、もしこのエリアに宿泊するならば西系・比系のホテルは日本人が多く、米欧中系は観光客比率通り、韓系ホテルは殆ど日本人はいません。
尚、欧米人は長期滞在者が多いのでこのエリアのリゾートホテルには殆どいません。

懸念される日本人遭遇ですが、ダイビングは日系サービスを使わず自分達グループでボートを貸し切れば済むことですし、ホテルはプライベートを重視した造りのリゾートを選べばいても気にならないと思いますし、食事も観光客向けの店に行かなければ済むのではないかと思います。
正味3日で初めてのセブなら、マクタンの東海岸のリゾート地区でゆっくり過ごした方が良いのではないかと思います。

それでも、どういても日本人に遭遇したくなく、更に韓国人などのアジア系にも遭遇したくないならば、必然的に観光客の少ないエリアにいくしかないと思います。
ですが、当然田舎になるので海以外何もないなど不便もあるかと思います。
欧米人はそういうエリアに多いです。

モアルボアル、ボホール島、バリカサグ島、マラパスクア島、オスロブとの候補ですが、3～6時間は掛かります。
日本人に遭遇したくない、そしてツアーを使わず自力でとのことならば、どこに行くにしても現地に宿泊した方がいいかと思います。
しかし、その候補の中でボホールと特にオスロブは日本人はたくさんいますので必ず遭遇すると思いますので除外します。

残り3箇所から総合的に判断すると、お勧めは一番移動に時間が掛かるマラパスクア島宿泊です。
日本人は殆どいない欧米人のリゾートです
24時間電気使用可 温水シャワー Ｗｉｆｉあり 食事豊富で味良し
1日目セブシティに宿泊して夕食・カジノ
2日目早朝セブシティを出発 昼過ぎホテル到着 半日白い砂浜のビーチでのんびり
3日目ダイビング3本＆カランガマン島アイランドホッピング
4日目早朝ダイビング1本 10時マラパスクア出発 14時頃にセブシティ 観光夕食カジノ
5日目マクタン空港より帰国
マラパスクアまでの移動は
バス：6時間(5時間+ボート1時間)　
GT・EXPRESS乗合ワゴン：4時間(3時間+ボート1時間)

ダイビング目的ならバリカサグをお勧めしますが…
残念なことにボホール島アロナビーチは日本人に遭遇します
又、バリカサグ島宿泊の場合もホテルは設備が良くないので。

モアルボアルはビーチフロントのホテルがないので…
半日白い砂浜のビーチでのんびりができませんので。

①多いです。観光客が多いので。ですが他の場所でもどこでもあります。　②マクタン東海岸リゾートエリア以外　③北部　④時間にルーズな国予定通りにいかない余裕を持ったプラニング　⑤ＩＴパーク付近 ウォーターフロントホテル　⑥夜はダウンタウン全域　コロン・バジル・マンゴー・カルボンマーケット

ジョイナーフィー(JF)1000php
これから予約するなら2名で予約しておけばJFは掛かりません。
既に予約済みならHPやFacebookでメールやメッセージで2名に変更の連絡を事前にすれば済む事だと思いますが。

個人的に行けます。
英語力あるならセブシティからのツアーで行く必要はないと思います。
そもそも、オスロブは観光地ですので英語力はそんなに必要ではありません。

しかし、日帰りで、バス・早朝出発で行き、全部自力はお勧めしません。
理由は、移動でヘトヘトな上、ジンベイ順番待ちで待たされるから。
個人的に行くなら、オスロブ現地ツアー利用した方が良いです。
移動は、2人なら③　3人以上なら②貸切がお勧めです。

日帰りでないなら④や⑤もご参考に。
マクタンのビーチリゾートに宿泊するくらいならパングラオ島の方がよっぽど良いリゾート地だと思います。
シャングリラの半額以下で5星ホテルに泊まれます。
オスロブに泊まるのはお勧めしません。
理由は、海は綺麗じゃないし、良い宿もないので。
オスロブ周辺に泊まるならシャングリラ並みに高いけどスミロン島をお勧めします。

行き方
①バス移動　4時間　300ペソ
Ayala PUV TerminalからSouth Bus Terminal タクシーで30分・150ペソくらい（渋滞があるので時間帯による）
　Bato行き　行き約3時間　帰り4時間　Aircon Bus　1人155ペソ

② V-Hires移動　3時間　2,000ペソ
Ayala PUV TerminalからSouth GT Expless Terminal　タクシーで20分・100ペソくらい（渋滞があるので時間帯による）
　Oslob行き　行き約2時間　帰り2.5時間　1人150ペソ　 貸切1500～2000ペソ（交渉）
〈South Bus Terminalにも居ます〉

③タクシー移動　2時間　3,000ペソ
行き約2時間　帰り2.5時間　2500～3000ペソ（交渉）

④船移動　6時間　1700ペソ　（アロナで1泊がお勧め）
Ayala PUV TerminalからPieｒ1　タクシーで20分・100ペソくらい（渋滞があるので時間帯による）
Pieｒ1からBohol Tagbilaran　2時間　400～500ペソ（運行会社による）
TagbilaranからPanglao Bus Terminal　トライシクル　10分・30～50ペソ（交渉）
Panglao Bus Terminalからアロナビーチ　30分・25ペソ
アロナビーチからオスロブ　バンカーボート2～2.5時間（天候による）1000ペソ　港からトライシクル　5分・25ペソ/1人

⑤飛行機　3時間半　5,000ペソ　（ドゥマゲテで1泊がお勧め）
Ayala PUV Terminalからマクタン空港　タクシー40分・200ペソくらい（渋滞があるので時間帯による）
マクタン空港からネグロス島デュマギット空港　50分・4500ペソ
デュマギット空港からSibulan Port Terminal　15分・タクシー250ペソ　トライシクル100ペソ
Sibulan Portからリロアン港　20分・65ペソ
リロアン港からバスターミナル　5分・30ペソ
リロアンからオスロブ　バス20分・55ペソ

https://www.mldivertown.com/
https://www.facebook.com/MLDIVERTOWN/

Ｍ＆Ｌ Diver Town
2017年4月から2001年より現地日本人、マネージャーだった本田さんの経営に変わり、それに伴い旧名「オーシャングローブ」から「Ｍ＆Ｌ Diver Town」に変更
M&Ｌ ダイバー タウン　https://www.mldivertown.com/

本田さんは温厚で真面目で非常に親切
何と言ってもこのショップの売りはビーチエントリーでもボートダイビングでも、どこを潜っても1本900ペソと非常に良心的な価格
他のモアルボアルの相場は大体1300ペソなので激安です
機材フルレンタルだと1本1200ペソ
場所はパナグサマビーチの1番南端にあり、ダイビングショップ密集地から外れています
とは言ってもが、パナグサマビーチと呼ばれるエリアは狭いので、密集地から200ｍほど
ボートに乗るには1番良い場所ではないかと思う
1番端にあるので、ショップ前まではトライシクルやバイクで直接行けないのが難点ではある
モアルボアルのバス停からトライシクルで行く時は、旧名「オーシャングローブ」と言わないとローカルの地元民でも分からないので。

1番近いレストランはCHILL BAR　徒歩1分100ｍ
だが、その隣のCAFE SEBUANOを勧める
どちらも海に面した席で食事ができ、眼下の海で海亀の泳ぐ姿が見られます

ガイドのフィリピーノ達は非常に若く多分20代前半なので、ベテランとは言えないので経験は浅くガイディングは上手くない
ダイビング最中はポイントのお勉強中なのか、ドロップオフの壁をつぶさにマクロ生物探しに夢中で、放ったらかしだが、初心者ダイバーでないのならこの方が自由に見て周れるので私には合っている
又、シャイなのか、あまり愛想は良くない
日本語が全く話せないのも原因だと思いますが

良い所ばかり書いているとショップの回し者と勘違いされるので、悪い点も書くとすると、ボートダイビングは2名から催行されるので、1人だと他に客さんが居ないとビーチエントリーのダイブになってしまう
しかし、ビーチエントリーでもイワシトルネードが見れます
以前はイワシはペスカドール島でしたが、現在イワシはショップ前のリーフに居ます
もう1つの難点は、1年以上のブランクダイバーはチェックダイビングをしなければいけない点であろうか
1本1600ペソ掛かります

ダイビングには関係ないが、私はパナグサマに宿泊でなくホワイトビーチ側に泊まったので移動の足が必要でしたが、ガイドからバイクを借りました
１日400ペソ110CCのスクーター　ボロくなく１年以内と思われる新しいバイクでした

現地についてからドライバーと交渉でいいのではないでしょうか？
タクシーなら5,000ペソと言われると思いますが交渉すれば値下げすると思います。
お勧めは、ドライバー付きレンターカーが1番面倒がなくていいと思います。
5人乗り乗用車4,200ペソ、バン6,500ペソ
日本から日本語で予約できるところもあります。

ガイドなしでマクタンのホテルからオスロブの送迎のみを幾らくらいでお願いしたいとお考えでしょうか？
多分、kkday.comのツアーの4,628円より安くお考えだと思いますが、車代だけなので半額くらいだったら良いとの目算でしょうか。
4,628円×4人÷2＝9,256円≒4,000php
4,000ペソだと車の往復料金分にしかなりませんので、この金額ではどのlocoさんも儲けが無いので手を挙げる金額ではないかと思います。
このツアーにはジンベイウォッチの入海料1,000ペソも込みなので安いと思います。
このツアーと同条件で、ご家族4人様だけ専用車でのツアーをやるlocoさんもいないと思います。

このkkday.comのツアーの車はToyota HiAce Vanとなっていますが、1名から参加できるようなので、貸切ではなく他のお客様と乗り合いのツアーだと思います。
ツアーですので、ギュウギュウ詰めではなく8人くらいまででしょう。
同日に他の予約客が入らなければ貸切と同じ状態でしょう。