早朝6時マンハッタンからニューアークEWR空港へはどう行くのが良いでしょうか？

くろさん、
詳しいご回答をありがとうございます！
時間が読めるし何より安いし、ホントは電車を使って行きたいのですが、日曜早朝の電車移動は果たして安全なのか、ペンステーションに朝早い時間にどの程度の利用者がいるのか、いちばん気掛かりなのはそこなのです。荷物が大変とかその辺は全然気にしておりません。階段多いよー、とかも全く大丈夫なんですが…。103stからペンステーションまでの地下鉄が危なかったら、そこまでウーバーで行くことなども考えているのですが、uberやlyft.での見積りが、日本からだとどうもうまく表示されません。
103st-NER間が100＄を超えてくると、ニューアークに宿を取った方がお得になるのですが、JFKからNER近くに荷物を一度置いてそこからNYCに戻るというのはちょっと時間のロスがありそう、とも思っております。それであればニューヨークのどこかに荷物を預けて遅い時間の空港バスか電車でニューアークに向かい、シャトル送迎でホテルに行った方が時間を有効に使えるかな〜と考えたり…
ホステルの無料キャンセル期間が迫ってきているので、そろそろ決断を迫られております。

ご評価いただきありがとうございます！
トランジットがJFK→EWRだと確かにマンハッタンでステイした方が時間的ロスが少なくてすみますね。

アッパーイーストサイドと仮定してUberの料金を調べてみました。
車両や条件により変わるようですが$20くらいからペンステーションへ行くことができるようです。

残念ながら早朝深夜など乗客が少ない時間の地下鉄利用が安全とは胸を張って言える状況ではないので、もし103丁目のホステルにお泊まりならUberなどを利用したほうが良いかも知れません。

ベストチョイスは「ペンステーション近辺のホテルに1泊してNJ Transitで列車移動」になるかと思います。宿泊料金は高くなりますが、

・JFKからAirTrain＋LIRRで安価に移動できる
・ホテル〜駅間をタクシーで移動しても10ドル前後

といった利点があります。

直前ですと$300前後から泊まれるところが多いようですが、これが高いか訂正価格かは、どれくらい利便性と安全を重視しているかにもよるので、コスト的には難しい判断となるかもですね（^_^;

くろ