こんにちは。マニラ在住者です。
まず、国際線はターミナル２は利用しません。国内線専用ターミナルです。したがって、ターミナル１か３となります。（日本→セブ→マニラのように国内線をかませばターミナル２になります。）
マニラ市内のどこに泊まるかによりますが、帰宅ラッシュと重なりますので渋滞は避けられません。とはいえ、最大1時間で市内のホテルには到着できると思われます。（金曜の夜だと、ちょっと読めませんがそれでも2時間はかからないはずです）
マニラ市内のホテルをどこにするかですが、マラテエリア（観光客が多い）、マカティエリア（ビジネス街）、パサイエリア（大きなモールがある）のいずれかになると思いますが、目的によって選んでください。
ちなみに、ターミナル３であれば、連絡通路を通じて徒歩で空港近くのホテルに到着することは可能です。
お問い合わせにある、Manila Airportホテルは、ターミナル１の近くで、徒歩圏内ですが
一旦空港を出るので治安が必ずしも良くはないので、タクシーでの移動をお勧めします。

タクシーは、どこのターミナルも２４H張り付いていますが、こちらも安全とは言い切れないので、ホテルのピックアップを頼むか、やむを得ない場合はエアポートタクシー（黄色いタクシー）が良いと思います。我々駐在者でさえ、タクシーは極力避けるようにしています。

ご参考ください

宿泊する場所にもよりますが、空港ターミナル３の近くあるいはパサイエリアであれば、わざわざ出歩かなくてもターミナル付近のホテルやビルで十分時間が潰せると思います。そこから、グリーンヒルズは初めてであれば諦めたほうが良いと思います。また、宿泊先がマカティエリアであればグリーンヒルズは行けます。あとはマラテエリアであればグリーンヒルズは諦めたほうが良いです。なぜ諦めたほうが良いかというと、交通渋滞によりその場所から空港までの時間が読めないからです。また、現在クリスマスシーズンに入りTAXIのぼったくりも増えつつありますので十分気をつけてください。