確かに、HP上では売り切れですね。調べてみたら、ガイド付きのチケットならありそうです。ご希望の日は英語のガイドならあるようです。日にちによっては日本語ガイドもあるようです。
https://www.tiqets.com/ja/amsterdam-attractions-c75061/tickets-for-anne-frank-walking-tour-p977245?partner=95014&selected_variant_language=eng
ちなみに公式HPで毎週火曜日、10：00に6週間先までのチケットが発売されるようです。

結構きついスケジュールですが、電車を調べて行ける感じならいいのではないでしょうか。ただオランダの電車は時々ストや事故で予定通りに動いていない時があるので、ns.nl で当日の情報を調べて行く方がいいと思います。

クレラー・ミュラー美術館の入り口は敷地に入ってから遠かったような。貸し自転車で移動します。森の中をいいお天気なら走ると気持ちいいですよ。

こちらのウェブサイトからチケット購入出来るようです。
www.waterbus.nl/tickets/werelderfgoed-kinderdijk-entree-vervoer
キンデルダイクと水上タクシーのコンビチケットで16,50ユーロです。
又は、www.waterbus.nl/en/about-the-waterbus では英語でチケットの説明があります。
チケットは予約では無いようですので、指定したチケットの日に使用すればいいようです。