Tomanさん

ご質問頂きありがとうございます。
下記、ご質問にお答えさせて頂きます。
何かご質問等ありましたら、
またお気軽にご連絡ください。

①アイランドホッピングは基本的にマクタン島発着が多いのか
　＝殆んどがマクタン島発着になります。
　　(※日本人利用者が少ないアイランドホッピング予約サイト)
　　→(http://www.islandsbanca.com/)

②日本人が少ないエリアはどこか
　＝セブ州で、マクタン島以外のリゾートとなると、
　　セブ州南部だと「オスロブ」や「モアルボアル」などが有名です。
　　車で片道２～3時間で行けます。
　
　北部ですと、バンタヤン島が有名ですが、車と船で片道　
　4時間近く掛ますので、日帰りだとおススメできません。
　北部、南部のリゾートは、マクタン島に比べると日本人は少ないです。

③北部と南部ではどちらがオススメなのか
＝②で言及したとおり、アクセスを考えると南部をおススメします。

④プランニングする上での注意点
＝途上国という事もあり、道路のインフラが粗悪です。交通渋滞が頻繁に起こります。またバスや船が予定通りに出発しない(船は雨が降ると割とすぐ欠航になる)事などもあるので、スケジュールをあまりタイトに組まず、時間に余裕をもったスケジューリングをおススメいたします。

⑤セブシティでホテルを探す時に観光に最適なエリアはどこか
＝観光、マリンアクティビティなどをマクタン島で予定される場合は、
　マクタン島にも比較的近い、 A.S.Fortuna(エー・エス・フォートゥナ)通り沿いのホテルが良いと思います。この通り自体もモールや飲食店など多く、栄えています。
セブシティーの観光だけを考えると、アヤラエリア(Ayara)が最適です。

⑥危険なエリアで立ち入るべきではない場所
＝セブシティーの南東部はダウンタウンと呼ばれ、Colon Street(コロンストリート)周辺は観光客狙いのスリや窃盗が多くあるらしく、なるべく避けるべきエリアです。

[[補足]]
セブ州に関しまして、
大きく分けてセブ島とマクタン島がありますが、
リゾートホテルやマリーンアクティビティ(アイランドホッピング、ビーチ、ダイビング)などは、マクタン島が中心です。セブ空港も、マクタン島に位置します。

マクタン島からセブ島の市街地までは、
タクシーで大よそ40分程度です。
時間帯や曜日(週末の夕方など)は交通渋滞が激しく、
2時間程度　移動にかかる事もあります。
その為、1日の間にマクタン島とセブシティーを行ったり来たりする、
というのは結構　時間のロスになります。。。

セブ島でビーチやリゾートを探す場合、
セブシティーから車で２，３時間離れた北部、南部になります。

tomanさんが希望するアクティビティや、滞在期間、移動の負担を考慮すると、
マクタン島を中心とした滞在がよいのではないかと思います。

例:
マクタン島のリゾートホテルで、比較的日本人に知られていないホテルに滞在し、
ホテルがオファーしているマリンアクティビティーなどに参加する。
滞在期間中に1日を、セブシティー観光の日にする、など)

<<備考情報>>

<<カジノ(ホテル内設カジノ含む)>>
・マクタン島
http://www.waterfronthotels.com.ph/waterfront-airport-hotel-and-casino/

・セブシティー
ーhttp://www.waterfronthotels.com.ph/
ーhttps://ja.foursquare.com/v/metro-card-club/4bcf02abfb84c9b607a1243e

<<ビーチ近くの日本人少な目のホテル>>
(※マクタン島のリゾートホテルだと、大抵ビーチが内設されています)
ーモーベンピックホテル(http://www.movenpick.com)
ービーリゾートホテル(http://www.beresorts.com/)
ージェーパークホテル(http://www.jparkislandresort.com/)

<<アイランドホッピング予約サイト(日本人利用者少なめ)>>
ーアイランドビアンカ(http://www.islandsbanca.com/)

<<大手セブ島情報サイト>>
(セブ島在中の邦人向けのフリーマガジン運営のサイト)
http://cebu-navi.com/sakura/