過去にagodaのトラブルについて動画にしたことがありますので、参考になれば幸いです。
https://www.youtube.com/watch?v=NO0NINOxBvo

ちなみに自分は何百回とホテルを予約してきてますが、これまでも今現在もagodaで予約してトラブルに遭ったことはないです。

ホーチミン市内での生ロイヤルゼリー購入についてですが、メコン川ツアーで販売されているものは農園直売品が多く、市内で全く同じパッケージのものを見つけるのは難しいですが、中身が同じ「生ロイヤルゼリー」であれば、市内の信頼できる専門店で購入可能です。

■探すべき商品名（店員さんに見せてください）
Sữa ong chúa tươi
（意味：生ロイヤルゼリー）
※「Tươi（トゥオイ）」が「生」という意味です。これがないとカプセルなどの加工品になります。

■おすすめの専門店（タクシーで行くのが確実です）

1. Behonex（ビホネックス）直営店
ベトナムで最も歴史ある養蜂企業の直営店で、品質管理がしっかりしており安心です。
住所：241A Nguyễn Trọng Tuyển, Phường 8, Phú Nhuận, Hồ Chí Minh
（1区中心部からタクシーで15分〜20分程度）

2. Highland Bee（ハイランドビー）
輸出品質のハチミツ製品を扱う有名ブランドです。
住所：15 Nơ Trang Long, Phường 7, Bình Thạnh, Hồ Chí Minh

■スーパーで探す場合
ロッテマートなどの大型スーパーでは、Xuân Nguyên（スアン・グエン）というメーカーのものが置いていることがあります。冷蔵コーナーを探してみてください。

持ち帰りの注意点ですが、「生」なので常温では劣化します。
購入後はホテルの冷蔵庫に入れ、帰国の際は保冷剤をつけてスーツケース（預け入れ荷物）に入れて持ち帰ることをおすすめします。

常にファストトラックで入国してますが、予約時に乗る便を入力するので、その便の遅延状況等を担当スタッフ（サービス会社）が確認・把握してるので遅れても問題ないです。

入国時間が14時ではなく深夜ということですかね？
経験上、極論ですが時間帯はあんまり関係ないです。運です。日中でも混んでる時もあれば空いてる時もありますし、深夜も同様です。

ファストトラックを使わずに2時間前についても遅れたことはないので、そこまで過敏になる必要はないかと思います。
逆に、早く行きすぎるとチェックインで待たされることが多いです（ベトナム人並んで待つの大好きなので）が、2時間前くらいだと15分くらいは待ちますけど早い方です。

スパですか？エステですか？どちらでしょうか？
美容エステではなくスパという前提でお話しすると、SENSE SPAはおすすめです。

日本語通じますし、予約もLINEで日本語で行えます。

自分が投稿してる動画見て、予約時に「トトの動画見ました」と伝えると30％OFFになります。

【ホーチミン マッサージ】本当は教えたくない、老若男女にオススメできる「上手い・綺麗・安い」マッサージ店「SENSE SPA」
https://youtu.be/4FNYKUNUPjY

場所はこちらです。
https://maps.app.goo.gl/airgo9ZDFbs15wGy7

ホーチミンに住んでます。
ガソリンに関しては、3月にSNSで「明日ガソリンがなくなる」というデマが流れて、ハノイ中心ですがガソスタに長蛇の列ができるほどのパニックが起きてましたが、政府は4月末までの国内燃料供給は十分に確保できていると4月4日に会見で語ってます。

また、Grabやタクシーが捕まりにくいなどは全くなく至ってこれまでの日常と変わりません。

自分は直接手続きの手助けをできませんが、Klookに代行してくれるサービスがあるので、それを利用してはいかがでしょうか？
自分は公式のオンラインでマルチビザ申請をして90日のVISAを取得しました。

https://www.klook.com/ja/activity/112769-vietnam-e-visa-service-for-international-tourist/?spm=SearchResult.SearchResult_LIST&clickId=e22e44be39

https://www.klook.com/ja/activity/161391-vietnam-e-visa-application-service-for-international-traveler/?spm=SearchResult.SearchResult_LIST&clickId=05191d76b6

現在ホーチミンに住んでおり、今月23日に日本へ弾丸で帰国します。
購入代行は可能ですが、一点だけ注意点があります。

今回の弾丸帰国では預け荷物なしで搭乗するため、購入した香水を機内持込に入れて持って帰ることになります。
ベトナムあるあるですが、保安検査員によっては、箱に書いてる容量チェックして問題なければそのままやり過ごしてくれる方もいれば、新品など関係なく開封され中身をチェックする方もいます。こればかりは時の運なので現時点でなんとも言えませんが、開封されてもいい・問題ないと言う場合、対応可能です。

なお、大阪に戻るので大阪からヤマト等で配送もしくは大阪でしたら23日夜に手渡しでお渡し可能です。