①wiseカードのタッチでオランダ国鉄、メトロ、トラムの利用はできますか？

大丈夫です。

②デルフトへ日帰り（Intercity利用で）の予定ですが、オランダ国鉄のアプリで事前にチケットを買うのと、カードタッチで乗り降りするのとどちらが安いですか？

同じです。

③電車の時間によってはdiscountになっているようですが、アプリで購入したのと違う時間の電車に乗っても大丈夫ですか？（アプリで購入したのがdiscountなのに、実際は正規料金の電車に乗った場合）

discountになっていなければ大丈夫です。

④オランダ国鉄のアプリの支払いカードにＷiseカードを指定できますか？
（カードが届いてから試してみればよいとは思いますが）

大丈夫です。

⑤Wiseカードでスーパーやレストランの支払いはできますか？

大丈夫です。

⑥Wiseカードでホテルの支払いはできますか？
(事前にクレジットカード情報は入力して現地決済予定になっています)

大丈夫です。

日本人なら個人事業主ビザか、就職先があるなら就労ビザですが、働き先は自分で決められるのですか？農業で最初から個人事業主は難しいかと思うので、まず求人情報などで農業関係の仕事を見つけるのが先決だと思います。仕事先が就労ビザの面倒を見てくれます。農場（ファーム）や園芸企業に雇われて働く場合、
または、高技能移民ビザ（Highly Skilled Migrant）で、農業技術、植物生産、畜産学、アグリテックなどの専門スキルがあり、オランダ企業に比較的、高給で雇われる場合など。農業起業は参入障壁が高いですが、日本食農産物・観光農園・花卉などなら可能性あると思います。
更に農業分野のテックはオランダが世界でもトップなので、スタートアップビザ（農業テック・新しい農法など）も可能かもしれません。
農業IoT、植物工場、持続的農法など「革新的農業」に関わる場合などです。
また、季節労働ビザ（Seasonal Workerで農業の収穫シーズンなど、数か月だけ働く事も可能だが、EU外からの季節労働者は制度が厳しく、やや難しいです。
その他、ワーキングホリデー（18〜30歳のみ）なども可能性としてはあります。