１）サンフランシスコに観光へ行く際、何時まで出歩いても大丈夫でしょうか？？
観光地と言っても道を一本はいればかなり危険な場所もあるので、人通りの多い道を歩くようにして下さい。ダウンタウンのショッピングができるあたりは人通りも多いのですが、あまり遅くならない時間に用事を済ませるのが良いのでは。
２）バークレーやオークランドには観光スポットはありますか？
バークレーは夜景が綺麗な丘があったり、バークレー大学近辺は美味しいレストランがあったりしますが、オークランドは特に観光で行くところは無いと思います。美味しいレストランが多々あるようですが、目的地に行くだけで、場所によってはかなり危険なので気をつけたほうが良いですね。
３）サンフランシスコやその周辺で、治安が悪いエリアはどの辺りでしょうか？
サンフランシスコ、ダウンタウンに限って言えば、Tenderloinと呼ばれるエリアはおしゃれなカフェやレストランもありますが一本はいるとかなり危険な場所もあります。ジャパンタウン近辺も危ないところもありますので、人通りがあまり無い場所を暗くなって一人で歩かないように。

グレイハウンドバスを使った事が無いので確実ではありませんが、座れない事は無いと思います。もし座れない場合は次のバスに変えてくれると思います。ちょっと調べましたが、電車とバスを乗り継いで行く方法がありますが、バスなら乗り継ぎなしにサクラメントまで行けるので、バスが確実と思います、料金も安いですね。私はサクラメントに1度行っただけで、お友達の家に行ったのでどこが一人で入りやすいなどはわかりませんが、サクラメントのどのエリアに行くとか明確に決めて行動予定を立てたほうが良いのではと思います。California Capital周辺を車で観光しましたが天気が良かったので、とても綺麗でした。アメリカは広い上に交通手段の車が無いとかなり不便です。サクラメントも広いのでこの辺とか絞ってもらえれば調べる事はできますので、必要であればご連絡下さい。

サンフランシスコからディズニーランドへは日本からサンフランシスコ-LAXもしくはオレンジカウンティの空港－日本の航空券で来たほうがお得だと思います。日程によってはサンフランシスコ-LAXの格安航空券もありますがクリスマス年末年始はかなり高めになると思います。アメリカのクリスマスは日本の年末年始のように家族で過ごすので街中で特にクリスマスのイベントなどはやっていません。最近はクリスマス後の大セールでお店も開いているところが増えましたが、日本のように華やかなものではありません。サンフランシスコよりはラスベガスの方が楽しいのではないでしょうか？日本からのパッケージツアーで来ると意外とお得だと思いますよ。ドレスアップしてホテルの美味しいビュッフェを食べるとか、見たいショー観に行くとかが楽しいのでは。学生さんだと年齢によっては入場制限、飲酒など厳しいですので事前に調べて下さい。年齢がわかる身分証明書は必ず持っていた方がいいですよ。
サンフランシスコのホテル事情はかなり高いですので、航空券+ホテルパッケージがお得だと思います。

サクラメントへはサンフランシスコからバス、電車で行けます。車だと3時間ぐらいでしょうか。
英語が話せなくても事前にバス、電車の時間を調べてチケットを手配しておけば問題ないと思います。
サクラメントへ到着してからどこに行くか決まっているのであれば、どうやって目的地に到着できるか事前に調べておく事をお勧めします。こちらの生活は基本、車での移動ですので、現地の人に聞いても車以外の移動手段を知らない事が多いです。もし何かあれば調べますのでご連絡下さい。

通常ですと冬は雨季で雨が多く、日本の冬に比べればかなり暖かいです。ダウンジャケットを日本から着て来て、寒くなったら着るつもりで持ち歩いても良いのでは。日中は暖かくなる事もありますので、長袖、厚手のジャケットでも大丈夫だと思います。こちらではいつも車で移動なので、厚手のジャケットは寒くなった時に着るように車に入れてあります。寒くなった次の日に春のように暖かくなったりする事もありますので、厚手のジャケットは必須です。

まずは、
1.アメリカは東海岸、もしくは西海岸からどちらから入国されるのでしょうか？
2.全日程の予定期間をお知らせください。
アメリカは国内でも東海岸と西海岸では3時間も時差があり、かなり広いので移動だけでも時間がかかりたす。
季節によっては飛行機の乗り継ぎが上手くいかなかったりとトラブル発生多々です。