初めまして、トロントへの旅行ももうすぐですね^ - ^
まだ何も決まってなければ良いのですが、参考になさってください。

まず何を念頭に置かれるかでだいぶ変わってきます。
DTホテルの場合は、仰る通り問題は駐車料金です。
しかし、郊外にホテルを取ってお車でDTまでいらっしゃると駐車料金もかかりますし、駐車場は日本に比べて無いので、パーキングスポットをいちいち探してパーキングチケットを毎度違うスポットで買うことになります。

この中で現実的なのは、ノースヨークにホテルを借りてTTCで移動するのが1番理想的です。
ノースヨークの場所にもよりますが、駅から近ければDTまでは電車で1本ですし、1dayパスを買うとご家族まとめてお得かもしれません。

ダウンタウンでも色々なところに観光名所が点在しているため、歩ける距離ですがとても疲れます。
結果TTCのデイパスを買うのであれば、ノースヨーク辺りのパーキングフィーフリーのホテルを探す方が良いかもしれません。
エトビコからもTTCで1本でDTに着きますが、エトビコは地域が広いので交通の便は良く無いかもしれません。
スカーボローは少し遠いのでオススメしません。

トロントを楽しんでいただけますように^ - ^