緊急で一時日本帰国しておりましたため、返信が遅れて大変申し訳ございません。

こちらTripAdvisorで検索してみたところ、色々なエージェンシーが見つかりました。
https://www.tripadvisor.com/Travel-g60713-c191550/San-Francisco:California:Tours.To.Yosemite.National.Park.html

個人的にヨセミテの日帰りはあまりお勧めしておりません。というのもグレーシャーポイントまで登るだけだとしてもサンフランシスコからだと8時に出ないときついです。

https://reservations.ahlsmsworld.com/Yosemite/Plan-Your-Trip/Tour-And-Activity-Search/Results
ヨセミテオフィシャルからも予約可能です。

まず、日帰りはどちらからになりますか？

基本海に囲まれているため、夏場でもわりと寒いです。12月でも雪こそないものの服装としては温かい格好でいらっしゃることをお勧めいたします。日本の冬とまでは言いませんが、ほとんどそのように考えていただいて問題無いです。

日本に緊急で一時帰国しておりました、回答が遅くなり大変申し訳ございません。
インラインで回答させていただきます。

///１　年越しを友人と２人、カリフォルニアのディズニーランドで過ごそうと考えています。サンフランシスコからカリフォルニアのディズニーまでの移動手段のおすすめを教えてください。（西海岸のPeterpan bus は危険とききました。）

カリフォルニアのディズニーランドということは、アナハイムですね？
MegaBus等長距離バスで100ドル以内に抑えて行く場合と、空路で行く場合の二択がメインになると思います。その他の策としては、サンフランシスコでレンタカーを借りてロサンゼルスかアナハイムで返すという方法もございますが、運転は6時間程かかるため（こちらのスピード感でいけばもっと早くつけますが）非常に疲れると思います。
今一度予算感をご教授いただければ、より細かい方法を明示できるかもしれません。

///２　サンフランシスコーラスベガス周辺でクリスマスを過ごすとしたら、どこが安くて楽しめるでしょうか？？（女子大学生、友人）

まずサンフランシスコからラスベガスまでは４−５時間の距離があります。ラスベガスですとどのホテルもおすすめですが、新しいWynnやAriaが僕は好きです。現在の住まいが僕はサンフランシスコですが、市内のホテルのほうがラスベガスよりも高いですので、予算と楽しめるイベントの数でいうと、完全リゾート地のベガスをお勧めします。
ただ、市内もとても綺麗ですので、市内のホテルに泊まって市内を観光するというのも、とても良いと思います。予算という観点と、ローカルかリゾート地のどちらを好むか、これらによって変わってくるのではないでしょうか？

///３　西海岸の宿泊地で、安くて安全なホステルや、airbnbのような宿泊施設は他にありますか？？
基本サンフランシスコはとても高いです。ロサンゼルスの方が平均的に安いのは間違いありません。Airbnb本社もサンフランシスコにあり、世界的にみても多数の人がホストとして家や部屋を貸し出しているため、それらに泊まるのも良策かと思われますが、値段の観点からいうと高いです。基本サンフランシスコ市内はワンルームで15万を下回るところがあまりないためです。

最安値を意識すると、ホステルになると思います。セキュリティー面も個室であればあまり問題ないかと思いますが、理想としてはチェーン展開している大手ホテル系で、中価格帯と言われている、Motel6　HolidayInn　BestWestern等がおすすめです。

諸事情で日本へ一時帰国していたため、遅くなってしまい大変申し訳ございません。

主観的な意見と、また実際の経験としましては、あまりお一人で行かれる方に同意したことはありません。一般論としても、お気づきの通りあまりお勧めする人もいないかと思います。

しかし、何かご用事があると見受けられますので、スケジュールやチケット手配、交通手段についてアドバイスできることはあると思います。

何も報酬は希望しておりませんので、本当に行かれる予定を計画中でしたら、お気軽にお声がけください。長年米国に住んでいる観点から、危険性の低いものをご紹介させていただきます。